More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0889 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0889  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122847  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4719  short chain dehydrogenase  90.08 
 
 		 252 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4196  short chain dehydrogenase  88.49 
 
 		 252 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5468  short chain dehydrogenase  92.12 
 
 		 241 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3552  short chain dehydrogenase  92.12 
 
 		 241 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4815  short chain dehydrogenase  92.12 
 
 		 241 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3788  short chain dehydrogenase  83.79 
 
 		 248 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  71.15 
 
 		 246 aa  328  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2430  short chain dehydrogenase  69.02 
 
 		 248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1926  short chain dehydrogenase  69.02 
 
 		 248 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00605891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1193  short chain dehydrogenase  69.02 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2074  short chain dehydrogenase  69.02 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0862  short chain dehydrogenase  69.02 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140204  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0299  short chain dehydrogenase  69.02 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71932  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  67.06 
 
 		 245 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1913  short chain dehydrogenase  69.02 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1636  short chain dehydrogenase  69.02 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  67.6 
 
 		 245 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.24 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.84 
 
 		 241 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5343  carbonyl reductase  50.4 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.8 
 
 		 242 aa  228  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0115742  normal  0.0276223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.28 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 		 242 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2155  short chain dehydrogenase  45.82 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0553289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  44.92 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  44.92 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  44.92 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  44.92 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  43.97 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  44.92 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  44.92 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 		 256 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  41.57 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.487626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281486  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  34.62 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 267 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.86 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  36.33 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03440  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.18 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2891  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.74 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000353377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 254 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.51 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0850  putative short-chain dehydrogenase/reductase  37.89 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.40253  normal  0.017932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11729  oxidoreductase  39.38 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123352  normal  0.515207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3418  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  38.49 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0308  putative short-chain dehydrogenase/reductase  40.71 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0774  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.91 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.448664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00771979  normal  0.364643 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>