More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6809 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 251 aa  161  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.848972 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  41.53 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.65 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 248 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.50771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.6 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  38.49 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  37.11 
 
 		 269 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 252 aa  151  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.8 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00771979  normal  0.364643 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1819  glucose 1-dehydrogenase  38.25 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00010189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.04 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  40.32 
 
 		 256 aa  148  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 247 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  34.13 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 260 aa  148  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 276 aa  148  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 		 224 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.2 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.94 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.65 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4208  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  33.47 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  37.1 
 
 		 260 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0423365  hitchhiker  0.00643231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  38 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1097  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  33.47 
 
 		 248 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>