More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3788 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3788  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 248 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798977 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4719  short chain dehydrogenase  81.42 
 
 		 252 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4196  short chain dehydrogenase  81.42 
 
 		 252 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0889  short chain dehydrogenase  83.79 
 
 		 252 aa  374  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122847  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5468  short chain dehydrogenase  85.12 
 
 		 241 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3552  short chain dehydrogenase  85.12 
 
 		 241 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4815  short chain dehydrogenase  85.12 
 
 		 241 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  71.49 
 
 		 246 aa  328  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  70.56 
 
 		 245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2430  short chain dehydrogenase  69.2 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1926  short chain dehydrogenase  69.6 
 
 		 248 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00605891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1193  short chain dehydrogenase  69.6 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2074  short chain dehydrogenase  69.6 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0862  short chain dehydrogenase  69.6 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1636  short chain dehydrogenase  69.6 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0299  short chain dehydrogenase  69.6 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71932  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1913  short chain dehydrogenase  69.6 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  68.7 
 
 		 245 aa  308  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.51 
 
 		 243 aa  258  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.96 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.38 
 
 		 241 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.17 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5343  carbonyl reductase  48.36 
 
 		 242 aa  221  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.25 
 
 		 242 aa  218  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0115742  normal  0.0276223 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.77 
 
 		 242 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  46.22 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  44.75 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2155  short chain dehydrogenase  46.96 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0553289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.7 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  45.06 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  44.13 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  42.13 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.53 
 
 		 235 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  43.25 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.487626 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.2 
 
 		 267 aa  154  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 254 aa  151  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281486  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  35.66 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1909  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.6 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00371976  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11729  oxidoreductase  39.22 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123352  normal  0.515207 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0850  putative short-chain dehydrogenase/reductase  40.48 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.40253  normal  0.017932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1693  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.66 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.523034  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2643  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.66 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.802213  normal  0.105966 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1803  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.66 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.686314  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2202  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.2 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03440  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  42.57 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.59 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 257 aa  138  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 251 aa  138  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  37.1 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>