More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5343 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5343  carbonyl reductase  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.25 
 
 		 242 aa  339  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.83 
 
 		 242 aa  329  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0115742  normal  0.0276223 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2430  short chain dehydrogenase  49.59 
 
 		 248 aa  239  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  51.04 
 
 		 245 aa  232  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1926  short chain dehydrogenase  49.18 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00605891  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1913  short chain dehydrogenase  49.18 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1193  short chain dehydrogenase  49.18 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2074  short chain dehydrogenase  49.18 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0299  short chain dehydrogenase  49.18 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.71932  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0862  short chain dehydrogenase  49.18 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1636  short chain dehydrogenase  49.18 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140639  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  49.59 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  47.5 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4719  short chain dehydrogenase  50.4 
 
 		 252 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.13 
 
 		 243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3552  short chain dehydrogenase  51.45 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5468  short chain dehydrogenase  51.45 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.107727 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4815  short chain dehydrogenase  51.45 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4196  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0889  short chain dehydrogenase  50.4 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122847  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3788  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798977 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.07 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 267 aa  148  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  35.97 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.4 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2155  short chain dehydrogenase  35.39 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0553289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2964  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  37.25 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  hitchhiker  0.0000180421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2523  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  37.25 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219217  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  32.4 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01763  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_6G09140)  36.48 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.134641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.62 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 246 aa  131  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.487626 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 270 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  35.83 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 249 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.14 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.74 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.92 
 
 		 248 aa  121  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.86 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 274 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.240969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281486  normal  0.727455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>