More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2835 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 256 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 256 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 256 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  70.31 
 
 		 256 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  63.67 
 
 		 257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  63.28 
 
 		 257 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  62.89 
 
 		 257 aa  301  9e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  58.06 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  58.06 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  58.06 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.01 
 
 		 255 aa  250  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  53.01 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.68 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  53.47 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  52.85 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  51.22 
 
 		 249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.63 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  51.98 
 
 		 256 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  51.98 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  51.98 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  51.98 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  51.98 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  51.98 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  51.98 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.17 
 
 		 235 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.74 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  45.6 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281486  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  43.65 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 		 263 aa  168  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2037  short chain dehydrogenase  40.77 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00988022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.39 
 
 		 251 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 267 aa  164  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  41.37 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.91 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730129 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5273  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.62 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000251333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.89 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  40.62 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3124  short chain dehydrogenase  42 
 
 		 262 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2133  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  44.4 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.617453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4719  short chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358577 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 		 516 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  39.36 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3035  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.77 
 
 		 251 aa  161  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4196  short chain dehydrogenase  40.61 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  41.04 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0481  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  44 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.55 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.65 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.74 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2397  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  40.08 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  40.32 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.74 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  40.7 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>