More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1057 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1057  short chain dehydrogenase; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11298  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 
232 aa  198  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
233 aa  181  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
227 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.32 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.112412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.89 
 
 
249 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
241 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0264  hypothetical protein  34.8 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0259  hypothetical protein  34.8 
 
 
232 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 
248 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
224 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.550294  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
240 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
224 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0291  hypothetical protein  33.19 
 
 
232 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
245 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
245 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
251 aa  105  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
240 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0400117  normal  0.51074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
240 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
240 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
262 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25957  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 
246 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 
246 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.17 
 
 
238 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 
257 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
252 aa  101  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
247 aa  101  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.439694  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
252 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 
248 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
256 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5275  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  30.54 
 
 
267 aa  99.4  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3453  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 
239 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
234 aa  99  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.75 
 
 
248 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0511  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 
235 aa  98.2  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
245 aa  97.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  34.36 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  29.54 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  29.11 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.41 
 
 
249 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.86 
 
 
246 aa  96.3  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
243 aa  95.9  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
251 aa  95.9  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.75 
 
 
245 aa  95.9  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
253 aa  95.5  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2155  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
245 aa  95.5  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0553289  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1415  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.57 
 
 
248 aa  95.5  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.949681  normal  0.622645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
237 aa  95.1  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
239 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 
247 aa  95.1  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
253 aa  94.7  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562893  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
246 aa  95.1  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.69 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01006  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  34.32 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.06 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000457862  decreased coverage  0.00144514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
254 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00521448  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.528532  normal  0.858497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2132  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.66 
 
 
244 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000343702  normal  0.0291609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  36.9 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
254 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.17 
 
 
245 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1363  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.92 
 
 
263 aa  93.2  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1784  putative oxidoreductase  31.28 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000312486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19210  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.23 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0908582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218659  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
253 aa  92.4  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
251 aa  92.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
250 aa  92.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.443482  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00988  dehydrogenase with different specificities  28.81 
 
 
250 aa  92  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06178  dehydrogenase with different specificities  28.81 
 
 
250 aa  92  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0668651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.96 
 
 
239 aa  92  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.39 
 
 
246 aa  92  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.04 
 
 
244 aa  92  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  30.29 
 
 
248 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 
233 aa  92  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2263  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 
249 aa  92  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412485  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.98 
 
 
251 aa  91.7  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221746  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.49 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0695  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.99 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5514  cyclopentanol dehydrogenase  30.23 
 
 
264 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.13 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1182  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.41 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.049347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>