More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0662 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
224 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.550294  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.88 
 
 
224 aa  333  1e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0511  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.62 
 
 
235 aa  314  7e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.27 
 
 
171 aa  259  2e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.90867 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
287 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1057  short chain dehydrogenase; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.62 
 
 
230 aa  108  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
240 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
232 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  33.62 
 
 
245 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.62 
 
 
245 aa  105  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  35.83 
 
 
286 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
287 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
297 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.15 
 
 
246 aa  101  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.15 
 
 
246 aa  101  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
247 aa  101  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
247 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  30.42 
 
 
267 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
266 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
263 aa  99.8  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 
288 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  31.95 
 
 
288 aa  99.4  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
285 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5223  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.96 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
285 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 
240 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
267 aa  98.6  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
286 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317832 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0948  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.98 
 
 
249 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000118605  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.33 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
286 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.05 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  29.71 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
282 aa  96.3  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10130  short chain dehydrogenase  40.35 
 
 
238 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206354  normal  0.858478 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.74 
 
 
306 aa  95.5  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.25 
 
 
248 aa  95.5  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
240 aa  95.1  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1360  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.42 
 
 
243 aa  95.1  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000468393  normal  0.0479743 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 
288 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  30.58 
 
 
288 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.07 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000457862  decreased coverage  0.00144514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  30.58 
 
 
288 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  30.58 
 
 
288 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  30.58 
 
 
288 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  30.71 
 
 
288 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  30 
 
 
317 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  30.58 
 
 
288 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2744  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
334 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0520687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  30.58 
 
 
288 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
285 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
253 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  33.06 
 
 
286 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
285 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
284 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5935  FixR protein  32.24 
 
 
282 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
287 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259282  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
246 aa  92.8  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
285 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
306 aa  93.2  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 
288 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.5 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.71 
 
 
243 aa  93.2  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1175  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.11 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.92 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000027021  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.78 
 
 
245 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
245 aa  92.4  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
248 aa  92  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.348466  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
247 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
245 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.03 
 
 
238 aa  92  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06640  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.42 
 
 
309 aa  91.7  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.88 
 
 
238 aa  91.7  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
285 aa  91.7  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 
285 aa  91.7  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  29.75 
 
 
288 aa  91.7  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
284 aa  91.7  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
285 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21608  predicted protein  32.27 
 
 
276 aa  90.9  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
285 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
264 aa  90.9  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 
286 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
299 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 
244 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 
286 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 
285 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217132 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00209875  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.42 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.753255  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000715788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.42 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.42 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1284  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.83 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.183563 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 
283 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>