More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21608 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_21608  predicted protein  100 
 
 
276 aa  575  1.0000000000000001e-163  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  44.23 
 
 
267 aa  208  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34089  predicted protein  43.89 
 
 
268 aa  202  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3595  tropinone reductase  38.61 
 
 
258 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.855153  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04045  tropinone reductase  39.06 
 
 
258 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1940  tropinone reductase  39.76 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.803191  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1875  tropinone reductase  39.76 
 
 
258 aa  179  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_51114  predicted protein  42.21 
 
 
268 aa  176  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
263 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
266 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
260 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
262 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
262 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
271 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
261 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
254 aa  139  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
262 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
267 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.239754  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.57 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.795595  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
252 aa  135  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  31.23 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0535  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 
262 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0083213  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  32.54 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1449  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.8 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0723888  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  34.35 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.8 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  32.58 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150046 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 
245 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
254 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.799434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2737  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.68 
 
 
249 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.35 
 
 
244 aa  125  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
255 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
255 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0755029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  33.09 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2778  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.15 
 
 
234 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
253 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
269 aa  125  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  30.94 
 
 
260 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
253 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
249 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3149  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
240 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
253 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
253 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
257 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  32.2 
 
 
260 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
240 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76943  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  34 
 
 
255 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.92 
 
 
248 aa  123  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
257 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
261 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877905  normal  0.0437007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
253 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
253 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1589  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.58 
 
 
243 aa  123  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.511722  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0433  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.33 
 
 
244 aa  123  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00087459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
260 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
256 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438607  normal  0.336746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
255 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
252 aa  123  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10890  putative short-chain dehydrogenase  33.6 
 
 
241 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0306888  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
256 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285018  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0650  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.26 
 
 
244 aa  122  5e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.280666  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
259 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
246 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
275 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.388897 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
252 aa  122  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.39 
 
 
246 aa  122  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
257 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.18 
 
 
251 aa  122  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
253 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
271 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  32.05 
 
 
260 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
253 aa  122  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  32.05 
 
 
260 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>