More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06178 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00988  dehydrogenase with different specificities  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06178  dehydrogenase with different specificities  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0668651  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.77 
 
 		 247 aa  346  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.439694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.93 
 
 		 245 aa  336  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.97 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00989  3-oxoacyl- reductase  47.7 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06177  3-oxoacyl- reductase  47.7 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 253 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 253 aa  158  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3878  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.08 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3094  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.08 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2881  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.08 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0100  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.08 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.231003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3960  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.08 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.255789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3456  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.08 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0629788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1663  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.08 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.97 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0095  putative short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.750807 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 250 aa  121  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  34.63 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1182  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.91 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.049347  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.2 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5573  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 		 268 aa  108  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1235  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183265  normal  0.0279411 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4111  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3998  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 252 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2299  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.56 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.686113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0623  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1837  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.16 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.62 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.98 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  31.64 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  31.2 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>