More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00989 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_06177  3-oxoacyl- reductase  100 
 
 
257 aa  519  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653597  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00989  3-oxoacyl- reductase  100 
 
 
257 aa  519  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.68 
 
 
253 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.98 
 
 
256 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.2 
 
 
249 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.93 
 
 
245 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.8 
 
 
247 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.439694  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06178  dehydrogenase with different specificities  47.7 
 
 
250 aa  202  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0668651  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00988  dehydrogenase with different specificities  47.7 
 
 
250 aa  202  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 
251 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
257 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
253 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
254 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
253 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3878  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.11 
 
 
252 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
253 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3960  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.11 
 
 
252 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.255789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1663  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.11 
 
 
252 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2881  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.11 
 
 
252 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0095  putative short chain dehydrogenase  42.11 
 
 
254 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.750807 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3094  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.11 
 
 
252 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.380527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3456  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.11 
 
 
252 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0629788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0100  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.11 
 
 
273 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.231003  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.82 
 
 
240 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
260 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
250 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  35.92 
 
 
254 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
251 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
254 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
247 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
248 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
248 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
258 aa  122  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
248 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4738  gluconate 5-dehydrogenase  31.47 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120281 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4831  gluconate 5-dehydrogenase  31.47 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4768  gluconate 5-dehydrogenase  31.47 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136475  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4887  gluconate 5-dehydrogenase  31.47 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 
245 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
250 aa  119  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4868  gluconate 5-dehydrogenase  31.08 
 
 
254 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.113188 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  32 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  32.8 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  33.47 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.58 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
255 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 
257 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
255 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02865  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4747  gluconate 5-dehydrogenase  31.87 
 
 
254 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
269 aa  115  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.255418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04132  gluconate 5-dehydrogenase  31.87 
 
 
254 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
254 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4522  gluconate 5-dehydrogenase  31.87 
 
 
254 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0305607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04096  hypothetical protein  31.87 
 
 
254 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3818  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.08 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0470155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.4 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003017  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  39.81 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00557089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
255 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
255 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
249 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.521278  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 
252 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
249 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
255 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  32.27 
 
 
248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
258 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
256 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
254 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
254 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
250 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  30.4 
 
 
254 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.51 
 
 
249 aa  111  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  30.4 
 
 
254 aa  111  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
255 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 
249 aa  111  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>