More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0880 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
251 aa  497  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0291  hypothetical protein  42.5 
 
 
232 aa  184  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0259  hypothetical protein  43.75 
 
 
232 aa  168  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0264  hypothetical protein  43.98 
 
 
232 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
262 aa  167  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
250 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
250 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027964 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
250 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.112412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1551  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
282 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489545  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
254 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00521448  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11298  short chain dehydrogenase  28.15 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
251 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.93 
 
 
249 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
268 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
269 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 
249 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 
252 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.09 
 
 
240 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
269 aa  105  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.08 
 
 
246 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
254 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1057  short chain dehydrogenase; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.32 
 
 
230 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.4 
 
 
247 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0095  putative short chain dehydrogenase  33.74 
 
 
254 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.750807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
255 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0755029  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
254 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 
236 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.433499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.49 
 
 
248 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
254 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
253 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
267 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  31.38 
 
 
251 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1051  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.93 
 
 
245 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305162  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 
253 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1526  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 
249 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
248 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0824  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.99 
 
 
255 aa  99.8  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.394944  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.94 
 
 
260 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
262 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
246 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
242 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699657 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
261 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1941  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.34 
 
 
234 aa  99.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923131  normal  0.859754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.743298  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2277  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.97 
 
 
234 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000536338  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
246 aa  99.4  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
253 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21780  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.8 
 
 
242 aa  99  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.58 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2778  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.24 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.78 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5343  carbonyl reductase  31.38 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2299  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.93 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.45 
 
 
246 aa  97.1  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
256 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.78 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.45 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.25 
 
 
245 aa  97.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.45 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  28.69 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  29.8 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1843  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.54 
 
 
234 aa  96.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136671  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  29.84 
 
 
257 aa  96.3  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  30.4 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
254 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1428  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.22 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.493611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
281 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
249 aa  95.9  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  27.85 
 
 
267 aa  95.9  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
252 aa  95.5  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  28.86 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.3 
 
 
246 aa  95.5  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.56 
 
 
251 aa  95.1  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.45 
 
 
247 aa  95.1  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.08 
 
 
245 aa  95.5  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
267 aa  95.1  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.75 
 
 
264 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 
246 aa  95.1  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.09 
 
 
245 aa  95.1  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.75 
 
 
264 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>