More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4331 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 257 aa  520  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.01 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.72 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 245 aa  218  7.999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.686113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.16 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  41.22 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  38.4 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.799434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0260  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.78 
 
 		 252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.734052  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3895  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.46 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  39.11 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5032  gluconate 5-dehydrogenase  37.3 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  33.2 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3035  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.16 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.2 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  37.25 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  37.8 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4743  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.35 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112688 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  38.25 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4263  gluconate 5-dehydrogenase  36 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 267 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04132  gluconate 5-dehydrogenase  38.74 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 		 263 aa  154  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04096  hypothetical protein  38.74 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 260 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4522  gluconate 5-dehydrogenase  38.74 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0305607  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 256 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  35 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4747  gluconate 5-dehydrogenase  38.34 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  36.61 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2904  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.42 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0374  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.82 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.333975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  36.95 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  35.2 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00521448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  35.08 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0620  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.27 
 
 		 247 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.506283  normal  0.100596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.82 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3406  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.76 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3977  putative 2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.34 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  34.27 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  34.39 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2136  gluconate 5-dehydrogenase  36.25 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510387  normal  0.0477177 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  36 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  36.29 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  35.6 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0335723  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1732  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.67 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.98 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.54 
 
 		 247 aa  148  6e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  35.6 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0344  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.22 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0349  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.89 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1671  Short-chain alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.321944  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>