More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5842 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
250 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.46 
 
 
250 aa  293  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.46 
 
 
250 aa  293  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027964 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.81 
 
 
248 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
262 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25957  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0291  hypothetical protein  33.75 
 
 
232 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0264  hypothetical protein  36.67 
 
 
232 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0259  hypothetical protein  37.34 
 
 
232 aa  121  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11298  short chain dehydrogenase  36.53 
 
 
232 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
254 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 
254 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0258116  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
233 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
244 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.112412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1215  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.89 
 
 
245 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.765065 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1896  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
247 aa  106  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.176277 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
250 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
261 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
254 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
251 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
254 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0458  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.49 
 
 
245 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
244 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
251 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
268 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.96 
 
 
246 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.49 
 
 
245 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.82564  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
249 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2299  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.31 
 
 
245 aa  101  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
250 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0497  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.36 
 
 
245 aa  101  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0087  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.07 
 
 
246 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
281 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
249 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
254 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
254 aa  99.8  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0571  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.21 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.653945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.8 
 
 
240 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1051  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.22 
 
 
245 aa  99.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305162  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.37 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.09 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285018  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438607  normal  0.336746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
249 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
249 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0708885  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.405915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.23 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.64 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 
248 aa  97.1  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221746  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.12 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3199  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.67 
 
 
246 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
269 aa  95.9  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0416  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.93 
 
 
245 aa  95.5  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  32.39 
 
 
258 aa  95.1  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  30.89 
 
 
260 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
244 aa  95.1  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.83 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0745  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  30.51 
 
 
245 aa  95.5  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451524  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  32.39 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
247 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.27 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  32.39 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  32.39 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  32.39 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
253 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
253 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 
251 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  32.39 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  32.39 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1526  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
249 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  32.39 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1626  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.2 
 
 
245 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813857  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  30.49 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0492  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29144  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
262 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>