More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05365 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  96.34 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  82.11 
 
 		 246 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  66.39 
 
 		 248 aa  350  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  54.88 
 
 		 241 aa  254  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  53.06 
 
 		 241 aa  248  8e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  51.22 
 
 		 246 aa  245  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  53.47 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.39 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  48.36 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3821  acetoacetyl-CoA reductase  53.47 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.82 
 
 		 245 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2402  acetoacetyl-CoA reductase  52.46 
 
 		 240 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0747  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.46 
 
 		 240 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  48.57 
 
 		 252 aa  242  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.6 
 
 		 244 aa  241  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 		 241 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.738636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  51.63 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2027  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 		 241 aa  240  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3065  acetoacetyl-CoA reductase  48.77 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000577101  normal  0.0493909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  52.85 
 
 		 241 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.03 
 
 		 241 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.6 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  52.85 
 
 		 240 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  48.16 
 
 		 248 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  48.16 
 
 		 248 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.01 
 
 		 245 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  46.75 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  49.8 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 		 246 aa  236  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1610  acetoacetyl-CoA reductase  51.21 
 
 		 247 aa  235  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.02 
 
 		 240 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0621  hypothetical protein  48.21 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  51.43 
 
 		 241 aa  234  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.22 
 
 		 245 aa  235  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  50.61 
 
 		 247 aa  235  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0604  hypothetical protein  48.21 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.81 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  48.57 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  48.39 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  49.39 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.21 
 
 		 245 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  46.77 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  48.37 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  47.76 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  50.81 
 
 		 242 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50 
 
 		 245 aa  232  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.19 
 
 		 245 aa  232  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.4 
 
 		 245 aa  231  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  47.81 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  46.94 
 
 		 248 aa  231  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  43.46 
 
 		 264 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  51.63 
 
 		 241 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  43.46 
 
 		 264 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  47.76 
 
 		 248 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.39 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  49.18 
 
 		 242 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.19 
 
 		 245 aa  230  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  45.56 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1574  acetoacetyl-CoA reductase  50.2 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50991  normal  0.311491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  48.37 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2293  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.77 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000712528  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  51.01 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.78 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  46.75 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  50.21 
 
 		 242 aa  228  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  50.4 
 
 		 242 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  47.15 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  47.15 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  47.15 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  47.15 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  44.9 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  50.4 
 
 		 242 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  47.15 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  47.15 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  47.15 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1759  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.99 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000535211  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  46.77 
 
 		 247 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1716  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.99 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000469264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  47.15 
 
 		 246 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  50.81 
 
 		 241 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  45.9 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1719  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.99 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  50.81 
 
 		 241 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  50.21 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2573  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.99 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000159991  hitchhiker  0.00324451 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  47.56 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2776  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.58 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  47.15 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  49.79 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  48.79 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  47.56 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  47.56 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  44.35 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  47.97 
 
 		 240 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  47.97 
 
 		 246 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  47.15 
 
 		 246 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1499  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.77 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000126797  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  47.15 
 
 		 246 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>