233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2872 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 318 aa  625  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19154  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.06 
 
 		 315 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0624  hypothetical protein  56.09 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0443  hypothetical protein  37.18 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.395434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7089  domain of unknown function DUF1731  38.05 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299999  normal  0.928503 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.21 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14210  conserved hypothetical protein TIGR01777  42.04 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000253357  decreased coverage  0.00429044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0594  hypothetical protein  41.9 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  36.92 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  33.23 
 
 		 313 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  37.03 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  35.28 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  33.23 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  32.2 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  33.23 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  33.23 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  33.23 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  33.23 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  33.23 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  33.23 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  33.55 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.92 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  37.69 
 
 		 299 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  32.92 
 
 		 297 aa  143  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.59 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.29 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  31.56 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  30.82 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  31.87 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  32.81 
 
 		 312 aa  139  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3001  hypothetical protein  33.84 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  29.65 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  32.92 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  32.92 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  32.92 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  32.2 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  32.6 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  32.92 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  30.65 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  30.52 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  31.75 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  30.43 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  28.57 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  32.69 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  33.08 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  33.46 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  28.21 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  28.21 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  31.27 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  27.59 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  33.08 
 
 		 297 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  29.54 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  29.54 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.54 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  32.69 
 
 		 297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3075  domain of unknown function DUF1731  35.58 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120809  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  29.6 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  32.05 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  30.49 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1735  domain of unknown function DUF1731  35.81 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.284327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  24.68 
 
 		 301 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  35.44 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0438  hypothetical protein  28.12 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  24.68 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  32.58 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  24.03 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  30.48 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  24.68 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  33.66 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1851  hypothetical protein  26.75 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  31.31 
 
 		 462 aa  123  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  31.97 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  30.19 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  32.7 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  23.7 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  23.7 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  32.6 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1325  domain of unknown function DUF1731  30.28 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.492061  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  24.03 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  24.03 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  28.12 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  31.66 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  31.66 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  28.94 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  27.95 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  32.05 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  30.41 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  30.09 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  37.46 
 
 		 298 aa  119  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  34.21 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  30.7 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  27.12 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  26.92 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  27.59 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>