244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3075 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3075  domain of unknown function DUF1731  100 
 
 
294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120809  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  52.76 
 
 
301 aa  295  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  55.29 
 
 
312 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3376  hypothetical protein  55.29 
 
 
312 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3325  hypothetical protein  55.29 
 
 
312 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  52.76 
 
 
305 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  52.07 
 
 
305 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  49.49 
 
 
299 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  45.52 
 
 
292 aa  251  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  49.49 
 
 
303 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  50.34 
 
 
297 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10480  conserved hypothetical protein TIGR01777  50.34 
 
 
294 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0100151  normal  0.069874 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1735  domain of unknown function DUF1731  45.87 
 
 
307 aa  226  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.284327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  42.95 
 
 
300 aa  225  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15450  conserved hypothetical protein TIGR01777  45.61 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.94 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3362  domain of unknown function DUF1731  45.27 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  46.05 
 
 
316 aa  218  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  46.6 
 
 
301 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  38.83 
 
 
300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  41.47 
 
 
462 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1863  domain of unknown function DUF1731  43.25 
 
 
293 aa  212  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508157  hitchhiker  0.00330545 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1601  domain of unknown function DUF1731  43.58 
 
 
303 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  41.28 
 
 
313 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  40.2 
 
 
297 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  41.44 
 
 
297 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3582  domain of unknown function DUF1731  47.32 
 
 
448 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  42.62 
 
 
304 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  43.77 
 
 
298 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0941  domain of unknown function DUF1731  45.45 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107088  normal  0.0358656 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  38.38 
 
 
297 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  38.38 
 
 
297 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  38.38 
 
 
297 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  38.38 
 
 
297 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  38.18 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.38 
 
 
297 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  39.06 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  39.06 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  39.06 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  39.06 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1516  domain of unknown function DUF1731  48.1 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  38.72 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  44.11 
 
 
453 aa  195  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  39.93 
 
 
301 aa  195  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  38.72 
 
 
297 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1861  domain of unknown function DUF1731  45.08 
 
 
300 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  38.72 
 
 
297 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.38 
 
 
297 aa  193  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  39.86 
 
 
302 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  39.86 
 
 
302 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.86 
 
 
302 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  39.53 
 
 
492 aa  192  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3280  domain of unknown function DUF1731  44.37 
 
 
296 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00976314  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  39.6 
 
 
304 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  40.91 
 
 
314 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  39.6 
 
 
301 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3558  hypothetical protein  40.4 
 
 
303 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69545  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.18 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  46.49 
 
 
449 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3324  hypothetical protein  40.69 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  40.82 
 
 
456 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  36.58 
 
 
295 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  38.05 
 
 
301 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1607  hypothetical protein  43.77 
 
 
314 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  38.13 
 
 
300 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  38.13 
 
 
302 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  40.88 
 
 
304 aa  179  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  34.52 
 
 
297 aa  179  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5147  domain of unknown function DUF1731  41.69 
 
 
308 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  37.54 
 
 
294 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.73 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  40.2 
 
 
295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  35.71 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  37.29 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  34.84 
 
 
309 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  37.62 
 
 
313 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  37.5 
 
 
298 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  35.37 
 
 
305 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  33.11 
 
 
301 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  42.37 
 
 
452 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  42.37 
 
 
452 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  42.37 
 
 
452 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  38.64 
 
 
308 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6071  domain of unknown function DUF1731  35.59 
 
 
303 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  35.86 
 
 
307 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1325  domain of unknown function DUF1731  38 
 
 
302 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.492061  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  35.86 
 
 
307 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  32.44 
 
 
301 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  33.11 
 
 
301 aa  168  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  37.66 
 
 
313 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  31.39 
 
 
310 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  34.52 
 
 
309 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26261  putative cell division inhibitor  37.25 
 
 
313 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  32.44 
 
 
301 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  32.44 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  32.44 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  34.45 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  32.67 
 
 
301 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  32.11 
 
 
301 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  36.3 
 
 
312 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>