223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7089 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7089  domain of unknown function DUF1731  100 
 
 
314 aa  659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299999  normal  0.928503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0443  hypothetical protein  46.51 
 
 
301 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.395434  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.33 
 
 
303 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0624  hypothetical protein  45.67 
 
 
345 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0594  hypothetical protein  45.42 
 
 
301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.05 
 
 
318 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19154  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14210  conserved hypothetical protein TIGR01777  40.63 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000253357  decreased coverage  0.00429044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
315 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 
313 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  36.42 
 
 
296 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  36.42 
 
 
296 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  32.9 
 
 
307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  36.42 
 
 
296 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  35.79 
 
 
299 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  34.22 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  33.33 
 
 
304 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  34.77 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  34.34 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  33.44 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  32.47 
 
 
305 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  32.12 
 
 
297 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  32.12 
 
 
297 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  32.36 
 
 
306 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  32.36 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  33 
 
 
297 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  31.79 
 
 
297 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  32.78 
 
 
301 aa  165  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  34.09 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  31.79 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  31.79 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  32.33 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  32.45 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  32.12 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1851  hypothetical protein  30.23 
 
 
289 aa  162  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  32.12 
 
 
301 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0782  hypothetical protein  31.67 
 
 
287 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.530957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  32.12 
 
 
301 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
301 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  31.51 
 
 
307 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  31.79 
 
 
301 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  32.03 
 
 
307 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  31.46 
 
 
301 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  31.79 
 
 
301 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  31.37 
 
 
304 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3001  hypothetical protein  34.89 
 
 
317 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  31.7 
 
 
300 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  32.9 
 
 
313 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  32.12 
 
 
301 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  33.12 
 
 
302 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  32.58 
 
 
306 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  30.45 
 
 
307 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  30.45 
 
 
307 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  30.36 
 
 
294 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  30.26 
 
 
297 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  31.43 
 
 
297 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  32.58 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  33.44 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
304 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  31.48 
 
 
302 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  33.55 
 
 
298 aa  152  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  32.57 
 
 
301 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  32.26 
 
 
301 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  32.13 
 
 
316 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  31.39 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  32.7 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  30.45 
 
 
311 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  29.68 
 
 
304 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  30.42 
 
 
306 aa  146  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  32.7 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  33.02 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  31.73 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  32.39 
 
 
297 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  32.39 
 
 
297 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  32.39 
 
 
297 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  32.39 
 
 
297 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7047  domain of unknown function DUF1731  32.04 
 
 
309 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  29.51 
 
 
299 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.61 
 
 
297 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
301 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  32.23 
 
 
304 aa  143  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  31.58 
 
 
298 aa  143  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  32.9 
 
 
300 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  31.27 
 
 
302 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.27 
 
 
302 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  31.27 
 
 
302 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.76 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2912  domain of unknown function DUF1731  30.03 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0344654  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  30.87 
 
 
464 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  30.97 
 
 
313 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  28.71 
 
 
310 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1325  domain of unknown function DUF1731  29.41 
 
 
302 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.492061  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
301 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
297 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  30.06 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  31.23 
 
 
297 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  31.23 
 
 
297 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  31.23 
 
 
297 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  31.23 
 
 
297 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  31.23 
 
 
297 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  28.57 
 
 
313 aa  136  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>