More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7047 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7047  domain of unknown function DUF1731  100 
 
 
309 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0064  hypothetical protein  42.62 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6071  domain of unknown function DUF1731  41.12 
 
 
303 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4158  domain of unknown function DUF1731  41.47 
 
 
303 aa  229  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0847  domain of unknown function DUF1731  41.2 
 
 
307 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  37.05 
 
 
304 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0156  sugar nucleotide epimerase  39.6 
 
 
299 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42276 
 
 
-
 
NC_002950  PG0996  hypothetical protein  35.62 
 
 
302 aa  203  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  35.41 
 
 
462 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  36.39 
 
 
298 aa  192  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  35.31 
 
 
297 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08971  possible epimerase, NAD dependent epimerase family protein  37.29 
 
 
302 aa  190  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.354262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  32.24 
 
 
304 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  35.71 
 
 
306 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  33.22 
 
 
307 aa  183  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  34.44 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  34.77 
 
 
301 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  34.77 
 
 
301 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  34.77 
 
 
301 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  36.67 
 
 
303 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  35.97 
 
 
302 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  34.32 
 
 
301 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  34.22 
 
 
311 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  34.77 
 
 
301 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  35.39 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  35.1 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  33.44 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  32.12 
 
 
297 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  34.21 
 
 
310 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  32.12 
 
 
297 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  32.12 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  32.12 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  32.12 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  31.15 
 
 
302 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.15 
 
 
302 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  31.15 
 
 
302 aa  179  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  32.23 
 
 
301 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  32.03 
 
 
297 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  32.03 
 
 
297 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  34.44 
 
 
301 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  32.03 
 
 
297 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  36.88 
 
 
300 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  34.44 
 
 
301 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  32.03 
 
 
297 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  35.88 
 
 
299 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  32.03 
 
 
297 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  34.55 
 
 
298 aa  176  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  35.55 
 
 
299 aa  176  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.7 
 
 
297 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
299 aa  176  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  34.43 
 
 
300 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  31.8 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.18 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  35.1 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.7 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  31.37 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  34.29 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  33.33 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  34.29 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
301 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  33.98 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  33.98 
 
 
298 aa  172  9e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  34.45 
 
 
300 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  32.56 
 
 
301 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0794  hypothetical protein  36.57 
 
 
300 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  31.92 
 
 
309 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0810  hypothetical protein  36.57 
 
 
300 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.55 
 
 
301 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  32.01 
 
 
301 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  33.33 
 
 
301 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  32.8 
 
 
306 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  32.91 
 
 
309 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  34.44 
 
 
300 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  32.58 
 
 
313 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  33.11 
 
 
492 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  31.37 
 
 
302 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  32.14 
 
 
297 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  33.77 
 
 
300 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  31.82 
 
 
304 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 
301 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  33.23 
 
 
295 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  32.67 
 
 
304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  31.35 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  31.95 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  35.33 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  33.77 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  32.27 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  32.48 
 
 
313 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  31.46 
 
 
305 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  33.01 
 
 
298 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  36.07 
 
 
295 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  33.22 
 
 
305 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
304 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  32 
 
 
297 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
297 aa  159  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  29.93 
 
 
499 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2494  domain of unknown function DUF1731  33.55 
 
 
288 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000945208  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  30.42 
 
 
499 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  30.42 
 
 
499 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  30.42 
 
 
499 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>