226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02301 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  100 
 
 
294 aa  611  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  53.08 
 
 
297 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  53.08 
 
 
297 aa  323  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  49.66 
 
 
304 aa  324  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  52.4 
 
 
297 aa  322  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  52.74 
 
 
297 aa  322  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  52.74 
 
 
297 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  52.74 
 
 
297 aa  322  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  52.74 
 
 
297 aa  322  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  52.74 
 
 
297 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  51.71 
 
 
297 aa  318  5e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  52.05 
 
 
297 aa  318  6e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  50 
 
 
301 aa  315  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  49.66 
 
 
301 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  50.34 
 
 
297 aa  311  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  50.34 
 
 
297 aa  311  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  50.34 
 
 
297 aa  311  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  50.34 
 
 
297 aa  311  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  50.34 
 
 
297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  48.63 
 
 
302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  48.44 
 
 
297 aa  308  8e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  45.39 
 
 
297 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  45.73 
 
 
297 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  45.39 
 
 
297 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  48.8 
 
 
295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  47.62 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  45.05 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  48.29 
 
 
302 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  48.29 
 
 
302 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  48.29 
 
 
302 aa  300  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  46.08 
 
 
297 aa  299  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  50 
 
 
304 aa  297  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  46.86 
 
 
309 aa  296  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  46.94 
 
 
296 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  46.94 
 
 
296 aa  296  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  47.44 
 
 
296 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  44.86 
 
 
297 aa  294  9e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  46.82 
 
 
304 aa  293  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  46.94 
 
 
296 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  45.36 
 
 
299 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  45.27 
 
 
301 aa  275  6e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  43.81 
 
 
307 aa  275  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  50 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  47.95 
 
 
298 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  46.58 
 
 
295 aa  269  2.9999999999999997e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  42.76 
 
 
301 aa  269  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  44.7 
 
 
307 aa  263  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  43.84 
 
 
300 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.26 
 
 
299 aa  256  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  43.88 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.27 
 
 
301 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  40.96 
 
 
302 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.54 
 
 
301 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  39.66 
 
 
309 aa  229  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.96 
 
 
301 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  41.02 
 
 
300 aa  225  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  39.59 
 
 
300 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  38.01 
 
 
298 aa  224  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  39.25 
 
 
305 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  37.97 
 
 
320 aa  222  6e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  39.25 
 
 
300 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  40.39 
 
 
309 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  37.95 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  39.12 
 
 
301 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  40.39 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  39.54 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  38.54 
 
 
307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  38.54 
 
 
307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  43.09 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.34 
 
 
301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0743  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.34 
 
 
301 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25533  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  37.16 
 
 
301 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  37.16 
 
 
301 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  38.18 
 
 
299 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  37.16 
 
 
301 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  36.82 
 
 
301 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  41.41 
 
 
298 aa  209  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  36.93 
 
 
310 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  39.25 
 
 
305 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  35.15 
 
 
464 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  37.95 
 
 
307 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  36.82 
 
 
301 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  37.16 
 
 
301 aa  208  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2361  hypothetical protein  45.81 
 
 
309 aa  208  7e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  38.87 
 
 
305 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  37.21 
 
 
306 aa  208  7e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  41.16 
 
 
302 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  36.49 
 
 
299 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  36.82 
 
 
301 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  36.49 
 
 
301 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  41.36 
 
 
478 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  36.82 
 
 
301 aa  205  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  35.88 
 
 
306 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  37.66 
 
 
309 aa  204  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  39.27 
 
 
304 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.93 
 
 
307 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.634966 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  37.87 
 
 
310 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  37.83 
 
 
313 aa  202  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  35.93 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26261  putative cell division inhibitor  37.05 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>