More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2243 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  607  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  61.79 
 
 
300 aa  353  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  48.68 
 
 
304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  51.16 
 
 
300 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  49.33 
 
 
295 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  43.1 
 
 
297 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  46.67 
 
 
302 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  46.67 
 
 
302 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  46.67 
 
 
302 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  45 
 
 
301 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  48.16 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  43.04 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.97 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  49.13 
 
 
305 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  50 
 
 
305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  43.92 
 
 
297 aa  252  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  48.16 
 
 
300 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  44.33 
 
 
301 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  43.81 
 
 
296 aa  250  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  42.9 
 
 
301 aa  250  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  42.76 
 
 
299 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  48.84 
 
 
298 aa  249  6e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  45.67 
 
 
296 aa  248  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  45.82 
 
 
296 aa  248  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.33 
 
 
301 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  45.82 
 
 
296 aa  248  9e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  45.64 
 
 
297 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  44.63 
 
 
297 aa  245  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  45.3 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  42.47 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  44.97 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  45.3 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  45.3 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  43.48 
 
 
301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  45.3 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  43.14 
 
 
302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  45.3 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.65 
 
 
301 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  43.23 
 
 
297 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  42.9 
 
 
297 aa  242  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  42.9 
 
 
297 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  41.91 
 
 
301 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  44.3 
 
 
297 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  42.57 
 
 
297 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  44.63 
 
 
297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  42.95 
 
 
297 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  42.95 
 
 
297 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  41.46 
 
 
316 aa  236  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  42.95 
 
 
297 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  42.95 
 
 
297 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  42.95 
 
 
297 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0743  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.5 
 
 
301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25533  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.17 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  44.16 
 
 
499 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  44.16 
 
 
499 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  44.16 
 
 
499 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  40.31 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  43.71 
 
 
499 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  39.66 
 
 
294 aa  229  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41380  sugar nucleotide epimerase  47.16 
 
 
317 aa  228  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  43.29 
 
 
464 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  40.97 
 
 
304 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  42.31 
 
 
309 aa  225  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  41.58 
 
 
298 aa  225  9e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  41.25 
 
 
298 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  41.69 
 
 
307 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  45.7 
 
 
295 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  39.47 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.54 
 
 
299 aa  219  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.84 
 
 
307 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.634966 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  43.42 
 
 
297 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  36.94 
 
 
307 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  36.94 
 
 
307 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  41.47 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  41.78 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  37.71 
 
 
295 aa  212  5.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  43.58 
 
 
478 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  40.72 
 
 
316 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.43 
 
 
321 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  41.53 
 
 
316 aa  209  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  36.36 
 
 
306 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3849  hypothetical protein  42.95 
 
 
489 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  34.11 
 
 
301 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  34.11 
 
 
301 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  34.11 
 
 
301 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  34.77 
 
 
301 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  37.87 
 
 
462 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  34.11 
 
 
301 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  39.34 
 
 
298 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.5 
 
 
304 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  39.67 
 
 
310 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  34.44 
 
 
301 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  34.44 
 
 
301 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  33.77 
 
 
301 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  36.63 
 
 
302 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  36.36 
 
 
307 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.43 
 
 
501 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  38.64 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  41.12 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  38.31 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>