233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2375 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  649    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  55.96 
 
 
320 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  41.46 
 
 
309 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  41.67 
 
 
300 aa  236  6e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  38.12 
 
 
301 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  39.62 
 
 
297 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  42.9 
 
 
296 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  42.58 
 
 
296 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  40.32 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  42.68 
 
 
296 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  39.3 
 
 
299 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  39.3 
 
 
297 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  39.31 
 
 
304 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  38.02 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.02 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  38.02 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  38.78 
 
 
300 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  38.98 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  40.88 
 
 
296 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  39.3 
 
 
301 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  40.38 
 
 
295 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  39.3 
 
 
301 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  39.43 
 
 
307 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  37.54 
 
 
304 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  41.08 
 
 
297 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  38.46 
 
 
298 aa  209  4e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  38.46 
 
 
298 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  41.21 
 
 
297 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  41.53 
 
 
297 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  38.34 
 
 
297 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  38.02 
 
 
297 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  41.21 
 
 
297 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.02 
 
 
297 aa  205  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  37.7 
 
 
297 aa  205  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  38.02 
 
 
297 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  38.02 
 
 
297 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  38.02 
 
 
297 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  41.21 
 
 
297 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  38.02 
 
 
297 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  38.46 
 
 
307 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  40.32 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  39.81 
 
 
499 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  39.81 
 
 
499 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  39.81 
 
 
499 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  38.12 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  36.45 
 
 
297 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  39.62 
 
 
300 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.06 
 
 
297 aa  199  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  41.16 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  37.58 
 
 
301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  39.42 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  36.66 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  37.46 
 
 
464 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  38.99 
 
 
309 aa  195  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  35.81 
 
 
297 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  35.81 
 
 
297 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  35.81 
 
 
297 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  35.81 
 
 
297 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  35.81 
 
 
297 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  35.53 
 
 
302 aa  192  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  38.89 
 
 
305 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  36.94 
 
 
499 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  38.12 
 
 
316 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  40.13 
 
 
295 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 
301 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  34.18 
 
 
299 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  38.71 
 
 
296 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.57 
 
 
301 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  36.84 
 
 
295 aa  186  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  35.65 
 
 
310 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  36.83 
 
 
478 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  38.73 
 
 
301 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  36.68 
 
 
308 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1851  hypothetical protein  36.77 
 
 
289 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  34.16 
 
 
306 aa  182  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  39.81 
 
 
297 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  36.94 
 
 
316 aa  182  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  35.81 
 
 
305 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  38.85 
 
 
305 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  36.68 
 
 
313 aa  180  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.78 
 
 
299 aa  179  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.31 
 
 
297 aa  179  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  35.26 
 
 
292 aa  178  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  34.67 
 
 
306 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
301 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
297 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  34.16 
 
 
307 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  36.02 
 
 
307 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  34.58 
 
 
308 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  34.16 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  34.16 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  35.87 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  35.65 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  35.2 
 
 
298 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3849  hypothetical protein  39.05 
 
 
489 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  36.74 
 
 
312 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3376  hypothetical protein  36.74 
 
 
312 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3325  hypothetical protein  36.74 
 
 
312 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01381  putative cell division inhibitor  33.96 
 
 
308 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.384424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>