247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1828 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  100 
 
 
300 aa  606  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  48.15 
 
 
299 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.67 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  48.36 
 
 
303 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  47.33 
 
 
298 aa  241  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3558  hypothetical protein  47.85 
 
 
303 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69545  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  45.3 
 
 
305 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  43.36 
 
 
301 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3324  hypothetical protein  47.44 
 
 
303 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  50.33 
 
 
301 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3362  domain of unknown function DUF1731  43.97 
 
 
302 aa  228  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236311  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  45.8 
 
 
305 aa  228  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  44.7 
 
 
297 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  43.81 
 
 
462 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  45.54 
 
 
297 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5147  domain of unknown function DUF1731  45.51 
 
 
308 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  44.86 
 
 
313 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  39.02 
 
 
300 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1735  domain of unknown function DUF1731  43.04 
 
 
307 aa  223  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.284327  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  43.85 
 
 
316 aa  222  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  43.56 
 
 
292 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0941  domain of unknown function DUF1731  47.37 
 
 
308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107088  normal  0.0358656 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  41.72 
 
 
300 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  41.61 
 
 
304 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  44.67 
 
 
453 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  42.57 
 
 
295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3280  domain of unknown function DUF1731  47.77 
 
 
296 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00976314  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  39.6 
 
 
301 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3075  domain of unknown function DUF1731  42.95 
 
 
294 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120809  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  45.45 
 
 
456 aa  209  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  41.14 
 
 
492 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  39.33 
 
 
305 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  38.02 
 
 
307 aa  208  9e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  38.94 
 
 
302 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  38.94 
 
 
302 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  43.62 
 
 
312 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.94 
 
 
302 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3376  hypothetical protein  43.62 
 
 
312 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  47.02 
 
 
449 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3325  hypothetical protein  43.62 
 
 
312 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  40.07 
 
 
297 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  40.07 
 
 
297 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  40.07 
 
 
297 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  40.07 
 
 
297 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  39.73 
 
 
297 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.73 
 
 
297 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  39.53 
 
 
297 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  39.67 
 
 
302 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  39.73 
 
 
297 aa  205  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  39.39 
 
 
297 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  40.07 
 
 
298 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  38.83 
 
 
306 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  37.29 
 
 
295 aa  202  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  39.74 
 
 
298 aa  202  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.06 
 
 
297 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10480  conserved hypothetical protein TIGR01777  42.57 
 
 
294 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0100151  normal  0.069874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  40.52 
 
 
307 aa  201  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  37.26 
 
 
306 aa  201  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1863  domain of unknown function DUF1731  43.56 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508157  hitchhiker  0.00330545 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  38.12 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15450  conserved hypothetical protein TIGR01777  42 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  38.51 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  38.16 
 
 
313 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  37.33 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
296 aa  199  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  36.57 
 
 
307 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  36.57 
 
 
307 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  37.54 
 
 
307 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  41.31 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  38.26 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1851  hypothetical protein  35.93 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.24 
 
 
321 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  35.74 
 
 
301 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  36.45 
 
 
306 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  37.17 
 
 
298 aa  193  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  37.58 
 
 
297 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  36.72 
 
 
301 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  35.67 
 
 
320 aa  192  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  39.67 
 
 
296 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  33.33 
 
 
310 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  35.24 
 
 
309 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  35.9 
 
 
309 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  33.33 
 
 
308 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  36.3 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  36.3 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  36.3 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  36.3 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01381  putative cell division inhibitor  33.33 
 
 
308 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.384424  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  36.3 
 
 
297 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  36.89 
 
 
313 aa  188  9e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1601  domain of unknown function DUF1731  41.58 
 
 
303 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  36.86 
 
 
313 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  44.12 
 
 
302 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  35.87 
 
 
313 aa  186  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0123  putative cell division inhibitor  33 
 
 
308 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1861  domain of unknown function DUF1731  41.58 
 
 
300 aa  185  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  36.54 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  39.86 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.87 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  37.97 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>