More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2460 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  100 
 
 
297 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  98.99 
 
 
297 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  98.99 
 
 
297 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  98.32 
 
 
297 aa  597  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  97.98 
 
 
297 aa  597  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  98.65 
 
 
297 aa  598  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  98.99 
 
 
297 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  98.99 
 
 
297 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  97.64 
 
 
297 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  86.2 
 
 
297 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  86.2 
 
 
297 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  86.2 
 
 
297 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  86.2 
 
 
297 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  85.86 
 
 
297 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  82.77 
 
 
297 aa  518  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  69.13 
 
 
302 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  69.13 
 
 
302 aa  431  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  69.13 
 
 
302 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  69.36 
 
 
304 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  67.34 
 
 
301 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  66.33 
 
 
302 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  66.78 
 
 
301 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  67.45 
 
 
301 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  51.7 
 
 
297 aa  329  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  53.08 
 
 
294 aa  323  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  51.52 
 
 
299 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  52.86 
 
 
295 aa  315  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  52.03 
 
 
297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  50.17 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  51.16 
 
 
304 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  49.16 
 
 
297 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  49.16 
 
 
297 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  49.49 
 
 
297 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  49.16 
 
 
297 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  48.01 
 
 
304 aa  295  9e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  51.18 
 
 
296 aa  295  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  49.83 
 
 
296 aa  294  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  50.84 
 
 
296 aa  293  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  48.34 
 
 
301 aa  292  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  50.84 
 
 
296 aa  291  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  49.66 
 
 
300 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  47.33 
 
 
301 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  47.87 
 
 
309 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.16 
 
 
301 aa  278  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  51.16 
 
 
316 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.36 
 
 
299 aa  276  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  47.37 
 
 
307 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  48.59 
 
 
295 aa  271  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  49.33 
 
 
296 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  50.99 
 
 
298 aa  267  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  49.5 
 
 
300 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  45.57 
 
 
307 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.33 
 
 
301 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  47.67 
 
 
300 aa  258  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  47.33 
 
 
300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  50.52 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.83 
 
 
301 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  50.67 
 
 
305 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  42.05 
 
 
302 aa  248  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  45.64 
 
 
309 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  44.48 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  42.81 
 
 
307 aa  241  9e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0743  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.67 
 
 
301 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25533  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  41.18 
 
 
307 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  41.18 
 
 
307 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.33 
 
 
301 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  42.02 
 
 
306 aa  239  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41380  sugar nucleotide epimerase  52 
 
 
317 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134678  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  40.13 
 
 
310 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  42.35 
 
 
307 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  41.81 
 
 
298 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  41.81 
 
 
298 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  47.32 
 
 
302 aa  235  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.18 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  41.18 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  39.81 
 
 
309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  39.41 
 
 
306 aa  232  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49 
 
 
307 aa  232  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.634966 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  41.72 
 
 
309 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  41.37 
 
 
312 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.52 
 
 
501 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  43.18 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  39.81 
 
 
309 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  43.42 
 
 
304 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  40.2 
 
 
313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  43.23 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.66 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  40.94 
 
 
464 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  41.31 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  44.85 
 
 
295 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  40 
 
 
313 aa  219  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  39.54 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  37.7 
 
 
310 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  39.93 
 
 
305 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.13 
 
 
297 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  42.52 
 
 
303 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  40.79 
 
 
462 aa  216  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  41.29 
 
 
314 aa  215  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  40.13 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  37.84 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>