256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1349 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  100 
 
 		 297 aa  584  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  56.31 
 
 		 301 aa  334  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  58.64 
 
 		 305 aa  329  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  60.68 
 
 		 312 aa  328  8e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3325  hypothetical protein  60.68 
 
 		 312 aa  328  8e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3376  hypothetical protein  60.68 
 
 		 312 aa  328  8e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  59.66 
 
 		 305 aa  326  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10480  conserved hypothetical protein TIGR01777  56.61 
 
 		 294 aa  295  8e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0100151  normal  0.069874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.87 
 
 		 297 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  51.84 
 
 		 303 aa  278  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1863  domain of unknown function DUF1731  52.72 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508157  hitchhiker  0.00330545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  47.62 
 
 		 292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3362  domain of unknown function DUF1731  54 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  52.35 
 
 		 301 aa  265  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3558  hypothetical protein  48.66 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69545  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3324  hypothetical protein  50.69 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  45.24 
 
 		 462 aa  252  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  50.68 
 
 		 316 aa  249  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3075  domain of unknown function DUF1731  50.34 
 
 		 294 aa  245  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  45.54 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15450  conserved hypothetical protein TIGR01777  48.65 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  47.1 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  42.81 
 
 		 297 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  44.22 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3582  domain of unknown function DUF1731  48.29 
 
 		 448 aa  222  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126499  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1861  domain of unknown function DUF1731  48.14 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3280  domain of unknown function DUF1731  50 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00976314  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  41.75 
 
 		 302 aa  218  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  41.75 
 
 		 302 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  41.75 
 
 		 302 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  41.89 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  41.81 
 
 		 300 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  41.72 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  37.8 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1607  hypothetical protein  47.12 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  35.22 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0941  domain of unknown function DUF1731  46.96 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107088  normal  0.0358656 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  40.53 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1601  domain of unknown function DUF1731  44.71 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  45.39 
 
 		 456 aa  208  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  37.92 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.2 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  40.62 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  39.87 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  39.87 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  39.87 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  39.02 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  39.87 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  39.87 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.53 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  37.62 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1516  domain of unknown function DUF1731  48.44 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  44.03 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  39.87 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.57 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  39.81 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  38.94 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1735  domain of unknown function DUF1731  43.19 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.284327  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  37.9 
 
 		 310 aa  198  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5147  domain of unknown function DUF1731  43.29 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  45.36 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  45.36 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  45.36 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  44.88 
 
 		 302 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  38.03 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  40.74 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  40.74 
 
 		 300 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  37.98 
 
 		 492 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  35.92 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.9 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  38.46 
 
 		 298 aa  193  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  38.21 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  40.2 
 
 		 304 aa  191  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  37.87 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  37.87 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  37.87 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  37.14 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  37.87 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  43.33 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  37.46 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1325  domain of unknown function DUF1731  38.08 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.492061  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  37.67 
 
 		 301 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  34.01 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  37.29 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  37.12 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  35.84 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  41.23 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  36.73 
 
 		 294 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  39.66 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  37.29 
 
 		 306 aa  185  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  40.69 
 
 		 305 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  35.69 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  40.6 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0064  hypothetical protein  32.78 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.89 
 
 		 301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  37.54 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>