299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1127 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  95.67 
 
 		 300 aa  554  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  72.58 
 
 		 300 aa  434  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.37 
 
 		 301 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.69 
 
 		 301 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0743  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.33 
 
 		 301 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.67 
 
 		 301 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.23 
 
 		 307 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.634966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  64.11 
 
 		 305 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  64.31 
 
 		 305 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41380  sugar nucleotide epimerase  64.33 
 
 		 317 aa  360  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134678  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  52.16 
 
 		 300 aa  309  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  47.67 
 
 		 302 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  47.67 
 
 		 302 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  47.67 
 
 		 302 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  48 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  48 
 
 		 297 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  48 
 
 		 297 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  48 
 
 		 297 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  48 
 
 		 297 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  48.33 
 
 		 297 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  47 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  47.67 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  46.33 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  47.67 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  46.67 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  45.9 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  48.49 
 
 		 309 aa  271  9e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  44.37 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  45.33 
 
 		 297 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  45 
 
 		 297 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  45 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  45 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  45 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  44.55 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  45.85 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  42.76 
 
 		 297 aa  265  8e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  46.64 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  45.97 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  43.67 
 
 		 297 aa  258  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  45.97 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  44.04 
 
 		 304 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  49.5 
 
 		 298 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.65 
 
 		 301 aa  254  9e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  43.85 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  42.67 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  42.33 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  42.67 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  42.33 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  42.47 
 
 		 296 aa  245  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  42.14 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  42.33 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  42.14 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  39.25 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.47 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  39.27 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  39.06 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  36.75 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  41.31 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  42.72 
 
 		 316 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 321 aa  228  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  40.07 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  39.73 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  41.69 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  35.43 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  40.33 
 
 		 310 aa  225  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  40.85 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  35.76 
 
 		 301 aa  225  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  35.1 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  35.43 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  35.1 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  38.03 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  35.1 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  35.1 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  39.4 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  40.74 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  38.87 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  41.22 
 
 		 464 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  39.46 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  34.67 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  36.89 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  36.89 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  36.98 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  42.19 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  39.62 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  45.21 
 
 		 295 aa  215  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  34.44 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  38.36 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  40 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  37.3 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  41.31 
 
 		 303 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  38.31 
 
 		 499 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  38.31 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  40 
 
 		 499 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  40 
 
 		 499 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  40 
 
 		 499 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.06 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  39.3 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.59 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  41.25 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>