More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1778 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.68 
 
 		 297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  55.33 
 
 		 299 aa  296  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  54.73 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  50.84 
 
 		 301 aa  278  8e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  53.04 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3362  domain of unknown function DUF1731  54.58 
 
 		 302 aa  271  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236311  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  49.16 
 
 		 462 aa  264  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  52.65 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3325  hypothetical protein  52.65 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3376  hypothetical protein  52.65 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  51.84 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  49.17 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3558  hypothetical protein  51.18 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69545  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  48.03 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  53.36 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15450  conserved hypothetical protein TIGR01777  51.17 
 
 		 315 aa  254  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  51.16 
 
 		 316 aa  252  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  46.44 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3324  hypothetical protein  51.38 
 
 		 303 aa  248  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  48.36 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.34 
 
 		 296 aa  242  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  41.84 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10480  conserved hypothetical protein TIGR01777  49.5 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0100151  normal  0.069874 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3280  domain of unknown function DUF1731  52.23 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00976314  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0941  domain of unknown function DUF1731  49.02 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107088  normal  0.0358656 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  43.81 
 
 		 492 aa  230  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3075  domain of unknown function DUF1731  49.49 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  45.34 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  48.17 
 
 		 453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  45.89 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  44.41 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5147  domain of unknown function DUF1731  47.33 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1863  domain of unknown function DUF1731  47.97 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508157  hitchhiker  0.00330545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  51.68 
 
 		 452 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  51.68 
 
 		 452 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  51.68 
 
 		 452 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  43.23 
 
 		 304 aa  219  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  51.16 
 
 		 449 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  47.67 
 
 		 456 aa  218  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  42.52 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  42.52 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  42.52 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  42.52 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  42.52 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  41.86 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  40.46 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1601  domain of unknown function DUF1731  47.97 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  42.76 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  40.46 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.22 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  41.86 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3582  domain of unknown function DUF1731  50 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126499  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  38.39 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  38.39 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  40.33 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40.33 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  40.33 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.57 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  40.34 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  39.67 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1861  domain of unknown function DUF1731  46.28 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  40.53 
 
 		 297 aa  209  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  38.85 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  38.41 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  40.91 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04550  cyclase/dehydrase ; Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  44.79 
 
 		 532 aa  208  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  40 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  41.2 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  40.86 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  40.86 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  40.86 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  40.86 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  38.31 
 
 		 313 aa  205  9e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1607  hypothetical protein  48.34 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  39.03 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  42.49 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  37.18 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  40.4 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1735  domain of unknown function DUF1731  44.74 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.284327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  41.45 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  37.62 
 
 		 306 aa  202  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  37.75 
 
 		 301 aa  201  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  41.31 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  37.1 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  36.01 
 
 		 306 aa  198  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  37.82 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  37.46 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1325  domain of unknown function DUF1731  40.44 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.492061  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  37.34 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  38.96 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  38.24 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  40.78 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  40.33 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  45.48 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  42.11 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.6 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.157693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>