272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1076 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 307 aa  608  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.634966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  73.99 
 
 		 300 aa  427  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.38 
 
 		 301 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  68.23 
 
 		 300 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.37 
 
 		 301 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  66.56 
 
 		 300 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41380  sugar nucleotide epimerase  72.19 
 
 		 317 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0743  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.71 
 
 		 301 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.71 
 
 		 301 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  68.01 
 
 		 305 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  67.6 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  53.67 
 
 		 300 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  49.33 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  49.33 
 
 		 297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  49.33 
 
 		 297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  49.33 
 
 		 297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  47.84 
 
 		 301 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  49.33 
 
 		 297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49 
 
 		 297 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  49 
 
 		 297 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  49 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  48.67 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  46.41 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  47.67 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  45.85 
 
 		 302 aa  258  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  45.85 
 
 		 302 aa  258  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  45.85 
 
 		 302 aa  258  7e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  46.33 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  46.18 
 
 		 301 aa  257  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  46.33 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  46.33 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  46.33 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  46.33 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  47.18 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  44.04 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  44.67 
 
 		 297 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  47.18 
 
 		 309 aa  252  6e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.66 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  46.18 
 
 		 297 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  48.99 
 
 		 298 aa  248  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  46.28 
 
 		 309 aa  247  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  42.24 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  47 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  44.82 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  44.48 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  44.48 
 
 		 297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  44.59 
 
 		 464 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  44.48 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.48 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  40.82 
 
 		 297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  39.93 
 
 		 294 aa  238  9e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  41.75 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  42.38 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.6 
 
 		 321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  41.06 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  43.14 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  41.81 
 
 		 499 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  41.33 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  42.81 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  42.81 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  45.51 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  42.47 
 
 		 298 aa  229  6e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  43.96 
 
 		 296 aa  228  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  41.33 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  39.06 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  37.09 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  36.75 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  36.75 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  36.42 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  46.82 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  35.43 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  42.14 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  36.75 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  41.86 
 
 		 499 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  41.86 
 
 		 499 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  41.86 
 
 		 499 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  35.43 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  35.43 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  35.1 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  35.1 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  45.7 
 
 		 303 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  41.5 
 
 		 316 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  38.36 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  39.47 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  45.54 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  39.56 
 
 		 320 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  42.47 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  39.49 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  45.03 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  40.94 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  43.33 
 
 		 478 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  40.47 
 
 		 311 aa  208  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  38.56 
 
 		 307 aa  208  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2912  domain of unknown function DUF1731  40.82 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0344654  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  40.13 
 
 		 298 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.14 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  37.94 
 
 		 307 aa  206  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  39.62 
 
 		 298 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.96 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  37.22 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>