More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2362 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  618  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  59.52 
 
 		 295 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  58.31 
 
 		 297 aa  364  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  57.29 
 
 		 297 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  57.63 
 
 		 297 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  57.29 
 
 		 297 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  57.29 
 
 		 297 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  58.5 
 
 		 299 aa  359  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  57.63 
 
 		 296 aa  345  5e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  53.33 
 
 		 301 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  55.93 
 
 		 296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  54.15 
 
 		 307 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  55.93 
 
 		 296 aa  335  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  55.93 
 
 		 296 aa  335  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  54.61 
 
 		 307 aa  326  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  52.79 
 
 		 309 aa  325  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  52.56 
 
 		 297 aa  322  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  51.35 
 
 		 301 aa  321  9.000000000000001e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  49.66 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  48.99 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  52.03 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  52.03 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  52.03 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  52.03 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  51.69 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  52.03 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  48.99 
 
 		 301 aa  310  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  51.69 
 
 		 297 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  51.01 
 
 		 297 aa  308  5e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  51.01 
 
 		 297 aa  308  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  48.49 
 
 		 301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  48.65 
 
 		 301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  48.65 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  48.65 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  48.65 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  50.34 
 
 		 297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  50.34 
 
 		 297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  50.34 
 
 		 297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  50.34 
 
 		 297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  50.34 
 
 		 297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  50.68 
 
 		 297 aa  301  7.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  46.69 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  44.86 
 
 		 294 aa  294  9e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  48.01 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  44.48 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  43.58 
 
 		 300 aa  269  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  43.1 
 
 		 309 aa  261  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  45.51 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.84 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  42.61 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  42.33 
 
 		 302 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  42.91 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  41.97 
 
 		 306 aa  238  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  40.58 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  40.58 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  41.31 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  43.48 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2219  hypothetical protein  41.55 
 
 		 293 aa  227  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.209038 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  39.02 
 
 		 306 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.39 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.24 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  41.04 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  37.16 
 
 		 499 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  37.16 
 
 		 499 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  37.16 
 
 		 499 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 501 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  39.87 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  41.75 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3001  hypothetical protein  37.97 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  40.27 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  40.27 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  39.3 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  39.06 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  40.13 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  36.15 
 
 		 499 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  39.73 
 
 		 305 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  37.5 
 
 		 464 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  42.95 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  36.48 
 
 		 320 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  38.26 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  39.09 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  39.39 
 
 		 300 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  37.66 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  41 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.73 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  36.7 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  37.21 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  38.31 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  36.36 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  36.03 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3849  hypothetical protein  37 
 
 		 489 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 		 321 aa  205  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  40.61 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  36.09 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.75 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.634966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  36.36 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  36.03 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  36.36 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  37.12 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  38.78 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>