More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4446 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 301 aa  593  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  90.94 
 
 		 301 aa  530  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0743  NAD-dependent epimerase/dehydratase  91.03 
 
 		 301 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  90.37 
 
 		 301 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  75.75 
 
 		 300 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  70.37 
 
 		 300 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  71.04 
 
 		 300 aa  407  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.38 
 
 		 307 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.634966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  64.31 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  65.62 
 
 		 305 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41380  sugar nucleotide epimerase  69.02 
 
 		 317 aa  354  8.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134678  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  51.83 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  50.17 
 
 		 297 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  50.17 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  50.17 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  50.17 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  50.17 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  50.66 
 
 		 297 aa  276  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49.16 
 
 		 297 aa  275  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  49.67 
 
 		 297 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  49.67 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  49.67 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  49.67 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  49.67 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49.5 
 
 		 297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  49.83 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  49.83 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  46.33 
 
 		 301 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  46.46 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  45 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  46 
 
 		 301 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  45 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  45 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  47.65 
 
 		 309 aa  256  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.19 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  43.67 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  45.12 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  45.79 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  49.49 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  43.52 
 
 		 301 aa  249  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  40.96 
 
 		 294 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  44 
 
 		 301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  42.19 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  45.45 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  41.86 
 
 		 302 aa  242  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  42.19 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  39.73 
 
 		 297 aa  234  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.67 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  41.41 
 
 		 297 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  42.9 
 
 		 298 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  39.8 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  41.75 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  41.41 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  41.08 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  38.72 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  43.1 
 
 		 296 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  43.1 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  41.08 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  43.67 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  43.61 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  42.81 
 
 		 311 aa  229  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  43.62 
 
 		 310 aa  228  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  42.62 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  42.24 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  35.12 
 
 		 301 aa  225  8e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  35.45 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  48.01 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.81 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  36.12 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.31 
 
 		 321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  35.23 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  35.12 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  34.56 
 
 		 301 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  33.78 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  34.78 
 
 		 301 aa  218  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  44.59 
 
 		 478 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  42.86 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0438  hypothetical protein  39.19 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  34.23 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  34.23 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  41.02 
 
 		 464 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  37.71 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  38.68 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  40.74 
 
 		 296 aa  215  9e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  40.6 
 
 		 499 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  38.31 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  44.15 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  39.54 
 
 		 307 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  37.58 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  37.58 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  45.1 
 
 		 299 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2219  hypothetical protein  38.21 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.209038 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  40.86 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1851  hypothetical protein  34.78 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0123  putative cell division inhibitor  37.58 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  43.43 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  37.58 
 
 		 308 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  39.47 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  42.16 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  38.51 
 
 		 309 aa  205  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.79696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>