243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0438 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0438  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  622  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0810  hypothetical protein  75.59 
 
 
300 aa  497  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0794  hypothetical protein  75.59 
 
 
300 aa  497  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  42.57 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  42.23 
 
 
301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  41.22 
 
 
301 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  41.89 
 
 
301 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  41.89 
 
 
301 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  41.89 
 
 
301 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  42.09 
 
 
301 aa  248  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  41.55 
 
 
301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  39.86 
 
 
301 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  39.53 
 
 
301 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  39.73 
 
 
305 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  40.46 
 
 
307 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  38.31 
 
 
307 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  38.31 
 
 
307 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  37.13 
 
 
306 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.78 
 
 
301 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  35.91 
 
 
297 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  35.29 
 
 
307 aa  203  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  36.24 
 
 
297 aa  203  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  36.24 
 
 
297 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  36.24 
 
 
297 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  36.24 
 
 
297 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  36.24 
 
 
297 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.58 
 
 
297 aa  202  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  36 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  36.16 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.19 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  35.55 
 
 
301 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.57 
 
 
297 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  35.81 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  37.33 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  35.69 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  35.81 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  35.81 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  35.81 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  35.57 
 
 
297 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  37.66 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  36.88 
 
 
301 aa  195  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  36.51 
 
 
304 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  36.45 
 
 
301 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  36.03 
 
 
297 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  35.43 
 
 
304 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
304 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  34.67 
 
 
304 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  35.14 
 
 
294 aa  188  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0743  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.44 
 
 
301 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25533  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  34.56 
 
 
298 aa  188  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 
301 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  34.22 
 
 
310 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 
301 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08971  possible epimerase, NAD dependent epimerase family protein  33 
 
 
302 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.354262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  35.22 
 
 
311 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1325  domain of unknown function DUF1731  35.1 
 
 
302 aa  186  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.492061  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38921  predicted protein  35.29 
 
 
373 aa  186  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  37.33 
 
 
300 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.21 
 
 
321 aa  186  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  35.33 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  35.88 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  35.88 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.88 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  33.55 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1851  hypothetical protein  33 
 
 
289 aa  183  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  35.91 
 
 
302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  33.97 
 
 
312 aa  182  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  35.02 
 
 
301 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  36 
 
 
299 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  34.23 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  34.12 
 
 
499 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0782  hypothetical protein  32.21 
 
 
287 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.530957  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  36.27 
 
 
305 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  36.05 
 
 
305 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  33.55 
 
 
309 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  32.57 
 
 
313 aa  176  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  33.87 
 
 
313 aa  175  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  32.45 
 
 
303 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2494  domain of unknown function DUF1731  36.45 
 
 
288 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000945208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  33.99 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  33.98 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  35.91 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  35.35 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  32.58 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  35.79 
 
 
297 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  33.33 
 
 
309 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  32.77 
 
 
499 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  32.77 
 
 
499 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  32.77 
 
 
499 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  34.8 
 
 
300 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  35.86 
 
 
296 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  35.09 
 
 
295 aa  170  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  33.11 
 
 
299 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  36.45 
 
 
309 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  32 
 
 
464 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.12 
 
 
299 aa  168  9e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  31.91 
 
 
304 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  32.58 
 
 
312 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  35.22 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>