More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3719 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  100 
 
 
304 aa  632  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0847  domain of unknown function DUF1731  45.3 
 
 
307 aa  278  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6071  domain of unknown function DUF1731  45.36 
 
 
303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4158  domain of unknown function DUF1731  43.96 
 
 
303 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0064  hypothetical protein  39.26 
 
 
303 aa  230  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0996  hypothetical protein  37.12 
 
 
302 aa  223  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  37.54 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  36.58 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  37.42 
 
 
310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08971  possible epimerase, NAD dependent epimerase family protein  37.79 
 
 
302 aa  210  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.354262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  37.88 
 
 
300 aa  209  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7047  domain of unknown function DUF1731  37.05 
 
 
309 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  36.42 
 
 
492 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  35.53 
 
 
307 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  35.53 
 
 
307 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  37.25 
 
 
300 aa  205  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  35.08 
 
 
301 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  36.91 
 
 
298 aa  202  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0156  sugar nucleotide epimerase  37.58 
 
 
299 aa  202  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42276 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.12 
 
 
297 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  36.12 
 
 
297 aa  201  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  36.12 
 
 
297 aa  201  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  36.12 
 
 
297 aa  201  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  36.12 
 
 
297 aa  201  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  34.87 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  36.24 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  35.79 
 
 
297 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  33.44 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  35.79 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  35.5 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  36.91 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  35.22 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.31 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  36.12 
 
 
299 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  34.64 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.45 
 
 
297 aa  196  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  36.09 
 
 
305 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  34.67 
 
 
302 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  35.47 
 
 
301 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  32.9 
 
 
307 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  36.91 
 
 
316 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  35.45 
 
 
297 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  35.45 
 
 
297 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  35.45 
 
 
297 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  35.45 
 
 
297 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  35.45 
 
 
297 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  37.11 
 
 
305 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  35.45 
 
 
301 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  38.33 
 
 
298 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  37.25 
 
 
299 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 
299 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  35.83 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  33.66 
 
 
302 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  34.9 
 
 
297 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  35.91 
 
 
303 aa  188  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  34.65 
 
 
302 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  36.42 
 
 
300 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  34.65 
 
 
302 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.65 
 
 
302 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 
301 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  33.44 
 
 
304 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
301 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  35.22 
 
 
298 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  35.76 
 
 
300 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  35.91 
 
 
462 aa  186  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  34.77 
 
 
298 aa  185  9e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  35.91 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  35.1 
 
 
300 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3001  hypothetical protein  34.38 
 
 
317 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  33.99 
 
 
308 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  35.05 
 
 
313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  39.14 
 
 
295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.79 
 
 
301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  182  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2912  domain of unknown function DUF1731  34.84 
 
 
313 aa  182  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0344654  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  35 
 
 
499 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  34.55 
 
 
298 aa  182  9.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
304 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  36 
 
 
299 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  35.57 
 
 
297 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  32.9 
 
 
464 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3645  domain of unknown function DUF1731  35.29 
 
 
298 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  35.06 
 
 
304 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  34.22 
 
 
297 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  34.22 
 
 
297 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  34.55 
 
 
297 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.28 
 
 
301 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  32.91 
 
 
313 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  34.78 
 
 
499 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  34.78 
 
 
499 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  34.22 
 
 
297 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  33.67 
 
 
301 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  34.78 
 
 
499 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  35.23 
 
 
294 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0743  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
301 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25533  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0133  domain of unknown function DUF1731  34.5 
 
 
316 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  34.11 
 
 
309 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
296 aa  175  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
301 aa  175  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>