231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1516 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
296 aa  573  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  49.49 
 
 
297 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  50.17 
 
 
303 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  45.85 
 
 
462 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  47.99 
 
 
299 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  43.48 
 
 
298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
297 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  47.12 
 
 
316 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  43.39 
 
 
305 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  43.85 
 
 
492 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3362  domain of unknown function DUF1731  45.3 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  41.69 
 
 
301 aa  219  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  42.52 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  35.84 
 
 
300 aa  208  8e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  41.67 
 
 
300 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.15 
 
 
321 aa  202  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0941  domain of unknown function DUF1731  44.33 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107088  normal  0.0358656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  42.81 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  42.57 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  39.94 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15450  conserved hypothetical protein TIGR01777  44.67 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  48.31 
 
 
452 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  48.31 
 
 
452 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  48.31 
 
 
452 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  38.41 
 
 
297 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  44.22 
 
 
301 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  41.14 
 
 
311 aa  192  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  37.79 
 
 
313 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.08 
 
 
297 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3558  hypothetical protein  44.63 
 
 
303 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69545  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  37.79 
 
 
313 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  45.76 
 
 
453 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  38.08 
 
 
297 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  38.08 
 
 
297 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  39.07 
 
 
309 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  36.88 
 
 
302 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  37.83 
 
 
313 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  38.08 
 
 
297 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  36.88 
 
 
302 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  38.08 
 
 
297 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  48.15 
 
 
449 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.88 
 
 
302 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  38.08 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1735  domain of unknown function DUF1731  43.62 
 
 
307 aa  187  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.284327  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  34.74 
 
 
307 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  34.74 
 
 
307 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  36.67 
 
 
297 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  39.67 
 
 
298 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  39.73 
 
 
300 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.42 
 
 
297 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  39.67 
 
 
298 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  37.42 
 
 
297 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3324  hypothetical protein  44.83 
 
 
303 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  41.89 
 
 
456 aa  186  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  39.32 
 
 
312 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3376  hypothetical protein  39.32 
 
 
312 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3325  hypothetical protein  39.32 
 
 
312 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  35.22 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  36.12 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3582  domain of unknown function DUF1731  44.3 
 
 
448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126499  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  38.41 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  38.41 
 
 
297 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  38.41 
 
 
297 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  38.41 
 
 
297 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  38.41 
 
 
297 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  37.16 
 
 
302 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  35.79 
 
 
301 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  37.46 
 
 
304 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  35.55 
 
 
301 aa  182  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3280  domain of unknown function DUF1731  44.83 
 
 
296 aa  182  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00976314  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  38.54 
 
 
309 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  36.84 
 
 
313 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  34.54 
 
 
301 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  38.51 
 
 
305 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  33.76 
 
 
310 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_002950  PG0996  hypothetical protein  35.23 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04550  cyclase/dehydrase ; Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  43.49 
 
 
532 aa  180  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  36.84 
 
 
313 aa  179  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1863  domain of unknown function DUF1731  41.22 
 
 
293 aa  179  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508157  hitchhiker  0.00330545 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  34.09 
 
 
306 aa  178  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  34.74 
 
 
306 aa  178  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  38.8 
 
 
313 aa  178  9e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  33.45 
 
 
294 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.59 
 
 
297 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  32.14 
 
 
307 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  33.66 
 
 
302 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  33.44 
 
 
309 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  33.44 
 
 
299 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  38.44 
 
 
305 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  36.45 
 
 
297 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  32.8 
 
 
309 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  34.09 
 
 
307 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  34.43 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2361  hypothetical protein  41.8 
 
 
309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  35.71 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  36 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  35.41 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  32.67 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  38.72 
 
 
292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  36.45 
 
 
297 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>