288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0961 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  100 
 
 
492 aa  1003    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  46.24 
 
 
462 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  51.82 
 
 
297 aa  276  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  40.13 
 
 
449 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  38.6 
 
 
453 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  38.83 
 
 
452 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  38.83 
 
 
452 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  38.83 
 
 
452 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04550  cyclase/dehydrase ; Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.89 
 
 
532 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  41.2 
 
 
300 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  44.77 
 
 
310 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  35.68 
 
 
456 aa  232  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  43.75 
 
 
298 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  45.51 
 
 
299 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3582  domain of unknown function DUF1731  36.65 
 
 
448 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  43.81 
 
 
303 aa  230  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  44.22 
 
 
316 aa  229  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  43.67 
 
 
298 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  40.33 
 
 
311 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.88 
 
 
297 aa  216  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.85 
 
 
296 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1735  domain of unknown function DUF1731  44.78 
 
 
307 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.284327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.72 
 
 
321 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  41.14 
 
 
300 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  42.62 
 
 
300 aa  209  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  36.42 
 
 
304 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  39.74 
 
 
301 aa  206  8e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  40.69 
 
 
305 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  36.6 
 
 
307 aa  202  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  40.39 
 
 
306 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  37.25 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  40.67 
 
 
304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2912  domain of unknown function DUF1731  39.49 
 
 
313 aa  201  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0344654  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  41.11 
 
 
313 aa  199  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  36.96 
 
 
301 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  37.79 
 
 
307 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  37.79 
 
 
307 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.38 
 
 
302 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  37.38 
 
 
302 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  37.38 
 
 
302 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  43.05 
 
 
301 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  37.5 
 
 
313 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  39.31 
 
 
305 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15450  conserved hypothetical protein TIGR01777  44.07 
 
 
315 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1325  domain of unknown function DUF1731  38.56 
 
 
302 aa  196  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.492061  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  34.75 
 
 
301 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  38.21 
 
 
297 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  38.24 
 
 
306 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  34.43 
 
 
301 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4158  domain of unknown function DUF1731  36.18 
 
 
303 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  34.75 
 
 
301 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
301 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  37.62 
 
 
301 aa  194  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  34.75 
 
 
301 aa  193  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  37.22 
 
 
307 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  34.43 
 
 
301 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  34.43 
 
 
301 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  38.54 
 
 
297 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  36.3 
 
 
301 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  37.16 
 
 
297 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  41.72 
 
 
302 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  37.16 
 
 
297 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  37.42 
 
 
304 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  37.16 
 
 
297 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  37.16 
 
 
297 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  37.16 
 
 
297 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38 
 
 
297 aa  190  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  36.98 
 
 
313 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0941  domain of unknown function DUF1731  39.74 
 
 
308 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107088  normal  0.0358656 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  38.51 
 
 
309 aa  189  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
297 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  37.5 
 
 
297 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  37.5 
 
 
297 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5147  domain of unknown function DUF1731  39.93 
 
 
308 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.82 
 
 
297 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  37.5 
 
 
297 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  37.5 
 
 
297 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  38.08 
 
 
297 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  37.29 
 
 
304 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41 
 
 
299 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  38.67 
 
 
292 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  37.16 
 
 
297 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  34.1 
 
 
301 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  34.88 
 
 
301 aa  187  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  37.67 
 
 
302 aa  187  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3558  hypothetical protein  38.74 
 
 
303 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69545  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  33.77 
 
 
301 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6071  domain of unknown function DUF1731  36.57 
 
 
303 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  36.63 
 
 
304 aa  186  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.82 
 
 
297 aa  186  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  37.16 
 
 
297 aa  186  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  41.72 
 
 
478 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3324  hypothetical protein  40.34 
 
 
303 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  42.52 
 
 
299 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  35.81 
 
 
312 aa  184  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  38.28 
 
 
499 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  38.28 
 
 
499 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  38.28 
 
 
499 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  39.48 
 
 
298 aa  183  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  37 
 
 
312 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>