261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15450 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_15450  conserved hypothetical protein TIGR01777  100 
 
 
315 aa  618  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1861  domain of unknown function DUF1731  52.33 
 
 
300 aa  269  5.9999999999999995e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  51.17 
 
 
303 aa  268  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  47.77 
 
 
313 aa  253  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  48.46 
 
 
299 aa  253  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  47.84 
 
 
305 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3280  domain of unknown function DUF1731  50.34 
 
 
296 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00976314  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  48.17 
 
 
305 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  48.65 
 
 
297 aa  242  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  48.04 
 
 
312 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3376  hypothetical protein  48.04 
 
 
312 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3325  hypothetical protein  48.04 
 
 
312 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.85 
 
 
297 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  45.33 
 
 
292 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  43.85 
 
 
301 aa  235  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.31 
 
 
303 aa  235  9e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.157693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  49 
 
 
301 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  46.8 
 
 
297 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  45.67 
 
 
316 aa  226  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1735  domain of unknown function DUF1731  47.52 
 
 
307 aa  225  8e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.284327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3558  hypothetical protein  46.42 
 
 
303 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69545  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3324  hypothetical protein  48.1 
 
 
303 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  42 
 
 
300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  44.07 
 
 
492 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  41.08 
 
 
462 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3075  domain of unknown function DUF1731  45.61 
 
 
294 aa  212  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  42.23 
 
 
298 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1863  domain of unknown function DUF1731  42.86 
 
 
293 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508157  hitchhiker  0.00330545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3362  domain of unknown function DUF1731  45.49 
 
 
302 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236311  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  37.97 
 
 
295 aa  209  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5147  domain of unknown function DUF1731  44.75 
 
 
308 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  36.7 
 
 
300 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.67 
 
 
296 aa  203  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  40.8 
 
 
300 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.28 
 
 
297 aa  202  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  38.28 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  38.28 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  38.28 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  38.28 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  37.93 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10480  conserved hypothetical protein TIGR01777  45.99 
 
 
294 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0100151  normal  0.069874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1601  domain of unknown function DUF1731  43.75 
 
 
303 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  38.41 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.59 
 
 
297 aa  199  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  37.93 
 
 
297 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  39.16 
 
 
297 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  37.37 
 
 
301 aa  195  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  41.81 
 
 
456 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  39.22 
 
 
311 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1607  hypothetical protein  46.28 
 
 
314 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  35.42 
 
 
310 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  39.68 
 
 
304 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  38.85 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  42.02 
 
 
314 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  35.35 
 
 
302 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  35.35 
 
 
302 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.35 
 
 
302 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  37.97 
 
 
294 aa  189  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  37.02 
 
 
297 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  37.02 
 
 
297 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  37.02 
 
 
297 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  36.51 
 
 
307 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  39.8 
 
 
306 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  37.02 
 
 
297 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  36.7 
 
 
301 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  37.58 
 
 
304 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  37.02 
 
 
297 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  40.58 
 
 
310 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  36.51 
 
 
306 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  34.87 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  36.84 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  36.84 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  45.76 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  36.55 
 
 
301 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  37.15 
 
 
302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.3 
 
 
321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 
297 aa  182  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  36.84 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  38.78 
 
 
298 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  37.04 
 
 
304 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0941  domain of unknown function DUF1731  42.95 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107088  normal  0.0358656 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  38.44 
 
 
298 aa  180  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  34.78 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38921  predicted protein  36.69 
 
 
373 aa  179  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  40.8 
 
 
308 aa  178  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4158  domain of unknown function DUF1731  37.54 
 
 
303 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  37.95 
 
 
313 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  36.36 
 
 
320 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.4 
 
 
304 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3582  domain of unknown function DUF1731  42.33 
 
 
448 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  39.8 
 
 
305 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  34.69 
 
 
305 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  46.82 
 
 
449 aa  175  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  43.19 
 
 
478 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  36.59 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.82 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  36.27 
 
 
313 aa  172  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0156  sugar nucleotide epimerase  36.24 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  34.22 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1516  domain of unknown function DUF1731  46.44 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>