More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4158 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4158  domain of unknown function DUF1731  100 
 
 
303 aa  621  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6071  domain of unknown function DUF1731  54.52 
 
 
303 aa  357  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  43.96 
 
 
304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0064  hypothetical protein  43.14 
 
 
303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0156  sugar nucleotide epimerase  43.58 
 
 
299 aa  239  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42276 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08971  possible epimerase, NAD dependent epimerase family protein  40.8 
 
 
302 aa  236  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.354262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7047  domain of unknown function DUF1731  41.47 
 
 
309 aa  229  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0847  domain of unknown function DUF1731  40.54 
 
 
307 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  39.81 
 
 
310 aa  225  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0996  hypothetical protein  39.53 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  38.69 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  37.46 
 
 
301 aa  215  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  36.79 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  36.79 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  38.72 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  36.45 
 
 
301 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  36.45 
 
 
301 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  36.79 
 
 
301 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  38.03 
 
 
306 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  38.82 
 
 
306 aa  209  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  36.45 
 
 
301 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  37.46 
 
 
298 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  36.12 
 
 
301 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  39.03 
 
 
313 aa  202  7e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  34.65 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  35.81 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  37.92 
 
 
297 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  39.47 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  34.43 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  37.58 
 
 
307 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  37.58 
 
 
307 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  36.75 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  36.07 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  38.87 
 
 
299 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  36.07 
 
 
302 aa  195  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  38.24 
 
 
313 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  36.18 
 
 
492 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  37.04 
 
 
462 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  35.29 
 
 
305 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  36.91 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  35.59 
 
 
297 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  35.59 
 
 
297 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  35.59 
 
 
297 aa  189  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  35.59 
 
 
297 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  35.59 
 
 
297 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  37.46 
 
 
301 aa  188  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  36.24 
 
 
304 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  37.04 
 
 
297 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  37.42 
 
 
313 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.92 
 
 
297 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  35.25 
 
 
297 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  35.45 
 
 
302 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  35.25 
 
 
297 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.79 
 
 
302 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.92 
 
 
297 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  35.79 
 
 
302 aa  186  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  37.82 
 
 
313 aa  186  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  35.79 
 
 
302 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  37.46 
 
 
301 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  35.91 
 
 
499 aa  185  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  36.36 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  34.95 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2912  domain of unknown function DUF1731  37.25 
 
 
313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0344654  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  35.2 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 
301 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  33.9 
 
 
297 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  33.9 
 
 
297 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  33.9 
 
 
297 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  33.9 
 
 
297 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 
304 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  34.3 
 
 
310 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 
301 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  33.9 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  35.41 
 
 
298 aa  179  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 
321 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  35.03 
 
 
309 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  34.74 
 
 
298 aa  178  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  34.95 
 
 
312 aa  177  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  38.13 
 
 
300 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  33.67 
 
 
297 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  32.78 
 
 
464 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  36.22 
 
 
313 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  37.33 
 
 
298 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  36 
 
 
301 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  35.35 
 
 
499 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  35.35 
 
 
499 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  35.35 
 
 
499 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  33.98 
 
 
308 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  36.49 
 
 
294 aa  176  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  34.08 
 
 
314 aa  175  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3849  hypothetical protein  36.09 
 
 
489 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  35.1 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3001  hypothetical protein  32.14 
 
 
317 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1851  hypothetical protein  32.43 
 
 
289 aa  171  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  36.36 
 
 
316 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  35.14 
 
 
312 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0123  putative cell division inhibitor  32.36 
 
 
308 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26261  putative cell division inhibitor  34.08 
 
 
313 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  32.27 
 
 
309 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  34.8 
 
 
295 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>