More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0091 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  100 
 
 
313 aa  638    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  70.93 
 
 
313 aa  475  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  69.65 
 
 
313 aa  448  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  67.09 
 
 
313 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  66.99 
 
 
313 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  65.18 
 
 
312 aa  419  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  62.62 
 
 
312 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  45.66 
 
 
307 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  44.01 
 
 
306 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  45.72 
 
 
311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  44.3 
 
 
310 aa  266  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  43.37 
 
 
306 aa  265  8e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  43.65 
 
 
298 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  41.1 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  40.95 
 
 
314 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  41.88 
 
 
307 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  41.88 
 
 
307 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2912  domain of unknown function DUF1731  43.09 
 
 
313 aa  241  7.999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0344654  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  40.84 
 
 
306 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  39.54 
 
 
302 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  40.46 
 
 
300 aa  229  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  37.66 
 
 
309 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  40.26 
 
 
309 aa  224  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  37.03 
 
 
309 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  39.87 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  39.87 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  39.87 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  39.87 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  40 
 
 
297 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.28 
 
 
321 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  39.54 
 
 
297 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.87 
 
 
297 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3001  hypothetical protein  38.02 
 
 
317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  38.76 
 
 
304 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  39.54 
 
 
297 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  40.52 
 
 
302 aa  218  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  42.48 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  39.81 
 
 
297 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  39.81 
 
 
297 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  39.81 
 
 
297 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  39.81 
 
 
297 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  39.81 
 
 
297 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.22 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  37.7 
 
 
305 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  40.33 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2361  hypothetical protein  41.64 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  37.83 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  35.71 
 
 
301 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 
297 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  35.33 
 
 
310 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.1 
 
 
304 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38921  predicted protein  37.58 
 
 
373 aa  210  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  39.68 
 
 
301 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  38.19 
 
 
297 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  39.54 
 
 
295 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  36.57 
 
 
301 aa  208  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  38.51 
 
 
302 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.51 
 
 
302 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  38.51 
 
 
302 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  35.71 
 
 
301 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  38.96 
 
 
299 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  36.25 
 
 
301 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  35.39 
 
 
301 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
301 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  35.71 
 
 
301 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  35.71 
 
 
301 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  38.36 
 
 
302 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  38.89 
 
 
464 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  35.26 
 
 
310 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  36.98 
 
 
300 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  38.41 
 
 
462 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  38.11 
 
 
301 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  38.24 
 
 
308 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  36.04 
 
 
301 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  36.33 
 
 
308 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0123  putative cell division inhibitor  35.42 
 
 
308 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4158  domain of unknown function DUF1731  39.03 
 
 
303 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  38.89 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  36.98 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  37.54 
 
 
499 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  41.03 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  34.09 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01381  putative cell division inhibitor  36.33 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.384424  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1851  hypothetical protein  36.72 
 
 
289 aa  200  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.23 
 
 
297 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  37.46 
 
 
297 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  37.54 
 
 
499 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  37.54 
 
 
499 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  36.84 
 
 
295 aa  199  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  37.54 
 
 
499 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  36.39 
 
 
299 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  37.13 
 
 
297 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0133  domain of unknown function DUF1731  36.59 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  37.82 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  34.75 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  36.81 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  37.13 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  38.11 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  38.26 
 
 
298 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  38.39 
 
 
298 aa  195  8.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>