297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0156 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0156  sugar nucleotide epimerase  100 
 
 
299 aa  604  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6071  domain of unknown function DUF1731  43 
 
 
303 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4158  domain of unknown function DUF1731  43.58 
 
 
303 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_002950  PG0996  hypothetical protein  39.53 
 
 
302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0064  hypothetical protein  41.95 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08971  possible epimerase, NAD dependent epimerase family protein  39.6 
 
 
302 aa  209  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.354262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7047  domain of unknown function DUF1731  39.6 
 
 
309 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  37.58 
 
 
304 aa  202  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  37.33 
 
 
295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  37.22 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  36.67 
 
 
305 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  37.54 
 
 
306 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  36.48 
 
 
313 aa  192  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0847  domain of unknown function DUF1731  34.56 
 
 
307 aa  192  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  35.31 
 
 
311 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  34.98 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  36.95 
 
 
300 aa  188  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  37.74 
 
 
312 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  36.16 
 
 
313 aa  187  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  34.2 
 
 
313 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  36.96 
 
 
298 aa  185  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  38.21 
 
 
301 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  37.01 
 
 
307 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  35.92 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  36.18 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  36.01 
 
 
312 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  36.63 
 
 
294 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  34.34 
 
 
313 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  35.53 
 
 
310 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  34.85 
 
 
313 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  35.31 
 
 
297 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  35.03 
 
 
306 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
304 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  37.17 
 
 
299 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  36.57 
 
 
307 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  33 
 
 
297 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  36.57 
 
 
307 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  36.3 
 
 
303 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  37.54 
 
 
308 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  33.11 
 
 
297 aa  175  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  33.77 
 
 
304 aa  175  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  33.67 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01381  putative cell division inhibitor  37.22 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.384424  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2494  domain of unknown function DUF1731  36.21 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000945208  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  38.8 
 
 
453 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  35.35 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  34.85 
 
 
313 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  34.77 
 
 
462 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 
301 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  34.18 
 
 
309 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  32.78 
 
 
492 aa  169  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  34.6 
 
 
309 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  35.6 
 
 
304 aa  169  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  35.12 
 
 
456 aa  169  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  35.81 
 
 
310 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.02 
 
 
297 aa  168  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  36 
 
 
301 aa  168  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  36 
 
 
301 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  36.33 
 
 
301 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  35.62 
 
 
301 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  35.97 
 
 
296 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  36 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  36 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04550  cyclase/dehydrase ; Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.91 
 
 
532 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  35.33 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  35.67 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  32.67 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  36 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0123  putative cell division inhibitor  35.28 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  36 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  33.33 
 
 
301 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  34.74 
 
 
307 aa  165  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  34.33 
 
 
296 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  34.74 
 
 
304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  37.21 
 
 
449 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0782  hypothetical protein  34.88 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.530957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  31.91 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  32 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  32 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  35.33 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  34.33 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  34.33 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  38.46 
 
 
452 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  38.46 
 
 
452 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  33 
 
 
299 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  38.46 
 
 
452 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  35.31 
 
 
300 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  34.44 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2912  domain of unknown function DUF1731  34.74 
 
 
313 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0344654  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  32.12 
 
 
301 aa  162  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  34 
 
 
297 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  33.33 
 
 
301 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26261  putative cell division inhibitor  34.95 
 
 
313 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  32.01 
 
 
297 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  32.01 
 
 
297 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  32.01 
 
 
297 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  32.01 
 
 
297 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  32.01 
 
 
297 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  31.37 
 
 
297 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>