233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5147 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5147  domain of unknown function DUF1731  100 
 
 
308 aa  608  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  49.16 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  45.51 
 
 
300 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  47.33 
 
 
303 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.16 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  41.97 
 
 
313 aa  215  8e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  42.19 
 
 
298 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  40.72 
 
 
300 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  39.93 
 
 
492 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  46.33 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3362  domain of unknown function DUF1731  43.71 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236311  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15450  conserved hypothetical protein TIGR01777  45.42 
 
 
315 aa  199  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  42.95 
 
 
297 aa  199  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  42.19 
 
 
305 aa  198  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  41.78 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  39.73 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3558  hypothetical protein  43.38 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69545  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  37.5 
 
 
304 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  36.79 
 
 
302 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  36.96 
 
 
301 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  40.33 
 
 
462 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.79 
 
 
302 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  36.79 
 
 
302 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3324  hypothetical protein  45.3 
 
 
303 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 
301 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  36.63 
 
 
301 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  37.63 
 
 
301 aa  192  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  35.66 
 
 
295 aa  190  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  37.46 
 
 
302 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3280  domain of unknown function DUF1731  45.67 
 
 
296 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00976314  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  41.41 
 
 
305 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.05 
 
 
321 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10480  conserved hypothetical protein TIGR01777  43.48 
 
 
294 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0100151  normal  0.069874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  43.43 
 
 
316 aa  189  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  34.74 
 
 
304 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  39.66 
 
 
300 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  33.89 
 
 
305 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  36 
 
 
300 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  43.29 
 
 
297 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  37.16 
 
 
297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  37.16 
 
 
297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  37.16 
 
 
297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  37.16 
 
 
297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  37.16 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.82 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  42.91 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  37.09 
 
 
300 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  40.26 
 
 
309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  36.82 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  44.07 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  36.82 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3376  hypothetical protein  44.07 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3325  hypothetical protein  44.07 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1863  domain of unknown function DUF1731  41.41 
 
 
293 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508157  hitchhiker  0.00330545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  36.75 
 
 
300 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  34.54 
 
 
302 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.48 
 
 
298 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 
301 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.15 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  36.67 
 
 
297 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  36.67 
 
 
297 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  36.67 
 
 
297 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  36.67 
 
 
297 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  42.62 
 
 
449 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  34.69 
 
 
294 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  32.67 
 
 
304 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  33.45 
 
 
297 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  36.33 
 
 
297 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  36.27 
 
 
297 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  34.01 
 
 
297 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.02 
 
 
303 aa  176  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.157693  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  40.54 
 
 
452 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  40.54 
 
 
452 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  40.54 
 
 
452 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3075  domain of unknown function DUF1731  42.71 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  33.55 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4158  domain of unknown function DUF1731  36 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1861  domain of unknown function DUF1731  42.18 
 
 
300 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  33.66 
 
 
307 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.2 
 
 
301 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  32.69 
 
 
307 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1607  hypothetical protein  45.96 
 
 
314 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  31.79 
 
 
301 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  32.78 
 
 
301 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  34.33 
 
 
297 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  31.53 
 
 
299 aa  169  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  32.12 
 
 
301 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0941  domain of unknown function DUF1731  42.67 
 
 
308 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107088  normal  0.0358656 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  31.46 
 
 
301 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  31.46 
 
 
301 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 
301 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  39.14 
 
 
310 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 
307 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.634966 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  31.79 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  33 
 
 
316 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  36.84 
 
 
311 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  35 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1601  domain of unknown function DUF1731  42.31 
 
 
303 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0743  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.33 
 
 
301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25533  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3001  hypothetical protein  37.05 
 
 
317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>