256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3558 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3558  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69545  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3324  hypothetical protein  92.74 
 
 
303 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3362  domain of unknown function DUF1731  52 
 
 
302 aa  282  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  49.16 
 
 
292 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  51.18 
 
 
303 aa  276  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  50.85 
 
 
299 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.69 
 
 
297 aa  268  8e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  47.85 
 
 
300 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  48.66 
 
 
297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  51.5 
 
 
301 aa  251  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  43.84 
 
 
301 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  46.33 
 
 
462 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  44.78 
 
 
298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  45.24 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1863  domain of unknown function DUF1731  47.49 
 
 
293 aa  231  8.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508157  hitchhiker  0.00330545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  45.03 
 
 
305 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  44.19 
 
 
313 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10480  conserved hypothetical protein TIGR01777  45.67 
 
 
294 aa  228  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0100151  normal  0.069874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  45.45 
 
 
312 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3376  hypothetical protein  45.45 
 
 
312 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3325  hypothetical protein  45.45 
 
 
312 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  47.62 
 
 
453 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  44.33 
 
 
300 aa  225  7e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15450  conserved hypothetical protein TIGR01777  46.94 
 
 
315 aa  222  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  43.73 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3280  domain of unknown function DUF1731  48.44 
 
 
296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00976314  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  44.37 
 
 
316 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  48.32 
 
 
449 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0941  domain of unknown function DUF1731  45.87 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107088  normal  0.0358656 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  44.85 
 
 
298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1861  domain of unknown function DUF1731  45.08 
 
 
300 aa  208  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  45.57 
 
 
302 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.42 
 
 
321 aa  205  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  43.81 
 
 
456 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.39 
 
 
301 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3582  domain of unknown function DUF1731  43.38 
 
 
448 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5147  domain of unknown function DUF1731  43.38 
 
 
308 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  36.72 
 
 
302 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  38.74 
 
 
492 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  35.08 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  35.08 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  37.38 
 
 
313 aa  200  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.63 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.39 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.157693  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  33.87 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  39.53 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  40.8 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  36.93 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  35.71 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  39.74 
 
 
300 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  37.58 
 
 
314 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  38.05 
 
 
298 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  37.71 
 
 
298 aa  196  6e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  39.4 
 
 
309 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.67 
 
 
304 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  37.67 
 
 
298 aa  193  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.53 
 
 
297 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  35.39 
 
 
306 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  34.75 
 
 
307 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  38.74 
 
 
302 aa  192  8e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.74 
 
 
302 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  38.74 
 
 
302 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  37.63 
 
 
304 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  34.41 
 
 
307 aa  191  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  35.45 
 
 
297 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  37.07 
 
 
294 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  37.25 
 
 
312 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  43.33 
 
 
478 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  37.33 
 
 
305 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  43.88 
 
 
452 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.33 
 
 
301 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  43.88 
 
 
452 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  43.88 
 
 
452 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  36.12 
 
 
301 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  37.66 
 
 
309 aa  189  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  36.79 
 
 
301 aa  188  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  38.31 
 
 
311 aa  188  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3075  domain of unknown function DUF1731  40.4 
 
 
294 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
297 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  37.17 
 
 
313 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1601  domain of unknown function DUF1731  42.32 
 
 
303 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.18 
 
 
297 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  38.51 
 
 
297 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  38.51 
 
 
297 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  38.51 
 
 
297 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  38.51 
 
 
297 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  38.51 
 
 
297 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  38.51 
 
 
297 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  34.42 
 
 
306 aa  186  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1325  domain of unknown function DUF1731  38.46 
 
 
302 aa  185  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.492061  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.67 
 
 
301 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  35.92 
 
 
306 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  36.91 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.31 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.634966 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  37.75 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.84 
 
 
297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  38.93 
 
 
297 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1607  hypothetical protein  44.71 
 
 
314 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  34.9 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>