236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1863 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1863  domain of unknown function DUF1731  100 
 
 
293 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508157  hitchhiker  0.00330545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  52.6 
 
 
305 aa  281  9e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  52.6 
 
 
305 aa  281  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  51.39 
 
 
301 aa  275  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  49.15 
 
 
292 aa  271  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  52.72 
 
 
297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  53.29 
 
 
312 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3376  hypothetical protein  53.29 
 
 
312 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3325  hypothetical protein  53.29 
 
 
312 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3362  domain of unknown function DUF1731  48.33 
 
 
302 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236311  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10480  conserved hypothetical protein TIGR01777  50.34 
 
 
294 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0100151  normal  0.069874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  47.97 
 
 
303 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.8 
 
 
297 aa  228  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  49.33 
 
 
301 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3558  hypothetical protein  47.49 
 
 
303 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69545  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  45.07 
 
 
299 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  46.28 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3324  hypothetical protein  48.26 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  43.56 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3075  domain of unknown function DUF1731  43.25 
 
 
294 aa  208  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120809  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15450  conserved hypothetical protein TIGR01777  42.86 
 
 
315 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  41.44 
 
 
297 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  41 
 
 
297 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  41 
 
 
297 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  41 
 
 
297 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  41 
 
 
297 aa  202  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40.67 
 
 
297 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  41 
 
 
297 aa  202  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  40.67 
 
 
297 aa  200  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.14 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  40.82 
 
 
462 aa  199  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  44.07 
 
 
316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  40.33 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  42.52 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.39 
 
 
298 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.82 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1861  domain of unknown function DUF1731  43.49 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40 
 
 
297 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3280  domain of unknown function DUF1731  46.29 
 
 
296 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00976314  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  41.5 
 
 
300 aa  192  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  41.02 
 
 
302 aa  193  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0941  domain of unknown function DUF1731  45.39 
 
 
308 aa  191  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107088  normal  0.0358656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  39.53 
 
 
304 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  39.53 
 
 
302 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  39.53 
 
 
302 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.53 
 
 
302 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  38.85 
 
 
301 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  43.81 
 
 
298 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.64 
 
 
303 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.157693  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.22 
 
 
296 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 
304 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1516  domain of unknown function DUF1731  45.67 
 
 
304 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  36.42 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  36.82 
 
 
295 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1607  hypothetical protein  42.12 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  38.18 
 
 
301 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3582  domain of unknown function DUF1731  43.15 
 
 
448 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  37.71 
 
 
301 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  42.74 
 
 
294 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5147  domain of unknown function DUF1731  40.4 
 
 
308 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1601  domain of unknown function DUF1731  40.07 
 
 
303 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  35.18 
 
 
306 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  40.48 
 
 
492 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  37.76 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.33 
 
 
299 aa  178  9e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  42.62 
 
 
453 aa  178  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  35.76 
 
 
306 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  33.9 
 
 
300 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  37.29 
 
 
298 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  34.44 
 
 
307 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  34.77 
 
 
307 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  34.77 
 
 
307 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  36.54 
 
 
313 aa  175  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  39.87 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  37.21 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  37.21 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  37.21 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  37.21 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  37.21 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.67 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  37.12 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  37.13 
 
 
306 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  35.47 
 
 
299 aa  172  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  33.89 
 
 
301 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  33.89 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  33 
 
 
304 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  33.74 
 
 
320 aa  171  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  38.56 
 
 
304 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  36.73 
 
 
297 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  43.75 
 
 
302 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  35.25 
 
 
297 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  39.06 
 
 
309 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  33.56 
 
 
301 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  33.56 
 
 
301 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  33.56 
 
 
301 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  35.02 
 
 
301 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  34.65 
 
 
307 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  32.66 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  33.56 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  34.78 
 
 
297 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>