209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1516 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1516  domain of unknown function DUF1731  100 
 
 
304 aa  588  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  48.83 
 
 
301 aa  241  9e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  49.33 
 
 
305 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  49.33 
 
 
305 aa  232  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  50 
 
 
312 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3376  hypothetical protein  50 
 
 
312 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3325  hypothetical protein  50 
 
 
312 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  48.33 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3075  domain of unknown function DUF1731  47.64 
 
 
294 aa  215  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120809  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1863  domain of unknown function DUF1731  46 
 
 
293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508157  hitchhiker  0.00330545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  46.53 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10480  conserved hypothetical protein TIGR01777  45.7 
 
 
294 aa  211  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0100151  normal  0.069874 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  43.97 
 
 
299 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  42.72 
 
 
300 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  42.05 
 
 
298 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  42.95 
 
 
297 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15450  conserved hypothetical protein TIGR01777  46.28 
 
 
315 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.87 
 
 
297 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  40.59 
 
 
292 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  43.42 
 
 
301 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  40.58 
 
 
314 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  44.22 
 
 
316 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  33.89 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3362  domain of unknown function DUF1731  39.35 
 
 
302 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236311  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1735  domain of unknown function DUF1731  39.55 
 
 
307 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.284327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  43.71 
 
 
453 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  37.12 
 
 
304 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  37.79 
 
 
302 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  37.33 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  36.63 
 
 
301 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  40.34 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3582  domain of unknown function DUF1731  42.71 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  37 
 
 
297 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  37 
 
 
297 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  37 
 
 
297 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1861  domain of unknown function DUF1731  43.85 
 
 
300 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  37 
 
 
297 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  38.26 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0438  hypothetical protein  34.11 
 
 
299 aa  162  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  35.88 
 
 
302 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.88 
 
 
302 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  35.88 
 
 
302 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  39.23 
 
 
311 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  36.67 
 
 
297 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  37.46 
 
 
462 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  36.96 
 
 
300 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  36.45 
 
 
297 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.33 
 
 
297 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  36.67 
 
 
297 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.87 
 
 
296 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 
304 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  35.37 
 
 
316 aa  159  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  41.72 
 
 
308 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.12 
 
 
321 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  34.65 
 
 
297 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  33.55 
 
 
305 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  35.6 
 
 
307 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0941  domain of unknown function DUF1731  41.18 
 
 
308 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107088  normal  0.0358656 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  34.36 
 
 
295 aa  156  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3558  hypothetical protein  40.66 
 
 
303 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69545  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  32.59 
 
 
302 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  36.33 
 
 
301 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  37.67 
 
 
304 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  36.18 
 
 
294 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  34.32 
 
 
301 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  40.79 
 
 
456 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  37.7 
 
 
309 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2165  hypothetical protein  31.91 
 
 
307 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  35.64 
 
 
298 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  35.05 
 
 
313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  32.57 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  35.31 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2139  hypothetical protein  32.25 
 
 
308 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  35.33 
 
 
301 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  34.01 
 
 
297 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  36.51 
 
 
492 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  36.66 
 
 
313 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  44.12 
 
 
449 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  31.92 
 
 
301 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  35.37 
 
 
313 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  35 
 
 
297 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  35 
 
 
297 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5147  domain of unknown function DUF1731  39.07 
 
 
308 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  35 
 
 
297 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  33.22 
 
 
301 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  32.89 
 
 
301 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  35 
 
 
297 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  32.89 
 
 
301 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  32.89 
 
 
301 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  40.73 
 
 
452 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  35 
 
 
297 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  40.73 
 
 
452 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  40.73 
 
 
452 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  32.57 
 
 
301 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3324  hypothetical protein  41.16 
 
 
303 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  32.89 
 
 
301 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  33.33 
 
 
304 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  35.65 
 
 
312 aa  149  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>