245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3580 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3580  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  607  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222015  normal  0.0797642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2934  hypothetical protein  89.84 
 
 
305 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3314  hypothetical protein  77.36 
 
 
312 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3376  hypothetical protein  77.36 
 
 
312 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3325  hypothetical protein  77.36 
 
 
312 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.231097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12244  hypothetical protein  71.96 
 
 
301 aa  435  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1349  domain of unknown function DUF1731  58.64 
 
 
297 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10480  conserved hypothetical protein TIGR01777  58.08 
 
 
294 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0100151  normal  0.069874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  54.73 
 
 
303 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3362  domain of unknown function DUF1731  53.74 
 
 
302 aa  275  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  54.73 
 
 
301 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1863  domain of unknown function DUF1731  52.6 
 
 
293 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508157  hitchhiker  0.00330545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3075  domain of unknown function DUF1731  52.76 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120809  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.11 
 
 
297 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00510595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4203  hypothetical protein  46.88 
 
 
292 aa  248  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0195164 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  48.11 
 
 
299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15450  conserved hypothetical protein TIGR01777  47.84 
 
 
315 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1828  domain of unknown function DUF1731  45.3 
 
 
300 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  43.46 
 
 
462 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0055  hypothetical protein  45.58 
 
 
298 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  47.96 
 
 
316 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3324  hypothetical protein  46.34 
 
 
303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  44.33 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3558  hypothetical protein  44.56 
 
 
303 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69545  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.39 
 
 
296 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.485931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0941  domain of unknown function DUF1731  45.27 
 
 
308 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107088  normal  0.0358656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  46.44 
 
 
453 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1861  domain of unknown function DUF1731  47.46 
 
 
300 aa  212  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1477  domain of unknown function DUF1731  40.33 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.43737  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  41.69 
 
 
304 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1735  domain of unknown function DUF1731  44.93 
 
 
307 aa  209  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.284327  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  40.4 
 
 
301 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  42.07 
 
 
297 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  36.21 
 
 
300 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1516  domain of unknown function DUF1731  49.48 
 
 
304 aa  205  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.59 
 
 
321 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  40.07 
 
 
297 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  40.07 
 
 
297 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  40.07 
 
 
297 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  40.07 
 
 
297 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  40.07 
 
 
297 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  41.5 
 
 
297 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  41.08 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  41.08 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  41.08 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  41.08 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  41.08 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  40.58 
 
 
310 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40.07 
 
 
297 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  39.25 
 
 
301 aa  199  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  40.74 
 
 
297 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40.4 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  39.12 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  46.58 
 
 
452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  39.12 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  46.58 
 
 
452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1601  domain of unknown function DUF1731  42.47 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  46.58 
 
 
452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.12 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3280  domain of unknown function DUF1731  47.04 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00976314  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  40.4 
 
 
297 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  39.31 
 
 
492 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.82 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  38.78 
 
 
301 aa  195  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  41.69 
 
 
314 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  36.45 
 
 
299 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  39.19 
 
 
302 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  38.64 
 
 
311 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  43.34 
 
 
456 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  47.12 
 
 
449 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5147  domain of unknown function DUF1731  42.19 
 
 
308 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  38.78 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  39.12 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  38.78 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  43.54 
 
 
298 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3582  domain of unknown function DUF1731  44.56 
 
 
448 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  37.76 
 
 
297 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  36.3 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  33.22 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.34 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2139  hypothetical protein  35.43 
 
 
308 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  37.79 
 
 
305 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  34.53 
 
 
307 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  36.43 
 
 
298 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  36.08 
 
 
298 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2165  hypothetical protein  35.67 
 
 
307 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  34.67 
 
 
302 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  36.3 
 
 
294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  36.09 
 
 
313 aa  179  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  36.86 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.21 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  37.2 
 
 
297 aa  179  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  34.56 
 
 
304 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  36.05 
 
 
296 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.99 
 
 
303 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.157693  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  40.7 
 
 
305 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  36.52 
 
 
297 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  36.52 
 
 
297 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  36.52 
 
 
297 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>