More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2922 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  85.14 
 
 		 296 aa  527  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  85.14 
 
 		 296 aa  527  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  85.76 
 
 		 296 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  71.28 
 
 		 297 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  67.57 
 
 		 297 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  67.23 
 
 		 297 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  67.23 
 
 		 297 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  67.23 
 
 		 297 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  61.64 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  61.15 
 
 		 295 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  59.34 
 
 		 307 aa  348  6e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  56.44 
 
 		 307 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  57.63 
 
 		 297 aa  345  5e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  55.15 
 
 		 301 aa  338  8e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  51.31 
 
 		 309 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  54.55 
 
 		 302 aa  318  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  54.55 
 
 		 302 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  54.55 
 
 		 302 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  51.85 
 
 		 304 aa  310  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  52.19 
 
 		 301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  51.52 
 
 		 302 aa  299  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  50.5 
 
 		 301 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  50.34 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  49.83 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  50.67 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  49.49 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  51.49 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  49.49 
 
 		 297 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  49.49 
 
 		 297 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  49.49 
 
 		 297 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  49.49 
 
 		 297 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  51.18 
 
 		 301 aa  292  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49.16 
 
 		 297 aa  291  7e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  49.16 
 
 		 297 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  46.94 
 
 		 294 aa  290  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  48.82 
 
 		 297 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  48.82 
 
 		 297 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  48.82 
 
 		 297 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  48.82 
 
 		 297 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  50.17 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  48.82 
 
 		 297 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  48.15 
 
 		 297 aa  285  8e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  52.81 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  49.5 
 
 		 304 aa  275  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  44.82 
 
 		 300 aa  258  8e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  43.81 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  44.11 
 
 		 296 aa  245  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  41.64 
 
 		 306 aa  241  9e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  44.11 
 
 		 298 aa  238  6.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  47.47 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  42.28 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  41.88 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  42.35 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  42.62 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  42.14 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  40.39 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  40.39 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  40.33 
 
 		 306 aa  230  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  42.81 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.47 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  39.2 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.74 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.46 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  43.43 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  40.45 
 
 		 309 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01381  putative cell division inhibitor  39.14 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.384424  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  39.61 
 
 		 310 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  38.82 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0123  putative cell division inhibitor  38.16 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  47.83 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  39.16 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  41.14 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  40.13 
 
 		 310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  40.13 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  41.14 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  40.4 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  40.33 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  40.88 
 
 		 316 aa  212  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  43.24 
 
 		 478 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2219  hypothetical protein  40.53 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.209038 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  39.54 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  42.51 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  38.51 
 
 		 464 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  37.69 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.75 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  43.37 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.8 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  38.78 
 
 		 499 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  38.78 
 
 		 499 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  38.78 
 
 		 499 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  39.74 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  37.63 
 
 		 499 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  39.13 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0743  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.74 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.08 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  41.61 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3849  hypothetical protein  39.53 
 
 		 489 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26261  putative cell division inhibitor  38.36 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1325  domain of unknown function DUF1731  38.49 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.492061  normal  0.369891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>