More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1109 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
313 aa  635    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0624  hypothetical protein  40.87 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0443  hypothetical protein  36.36 
 
 
301 aa  198  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.395434  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
318 aa  195  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19154  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7089  domain of unknown function DUF1731  35.05 
 
 
314 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299999  normal  0.928503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.63 
 
 
315 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 
303 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14210  conserved hypothetical protein TIGR01777  38.39 
 
 
310 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000253357  decreased coverage  0.00429044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0594  hypothetical protein  37.94 
 
 
301 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  33.96 
 
 
306 aa  152  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  34.21 
 
 
304 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  31.41 
 
 
307 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  31.41 
 
 
307 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  31.96 
 
 
306 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  30.77 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  35.18 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  34.64 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  33.65 
 
 
309 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  32.17 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  32.27 
 
 
464 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  34.64 
 
 
297 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26261  putative cell division inhibitor  33.01 
 
 
313 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  33.66 
 
 
311 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
304 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  33.87 
 
 
499 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  33.64 
 
 
499 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  33.64 
 
 
499 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  33.64 
 
 
499 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  36.31 
 
 
312 aa  142  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  31.13 
 
 
307 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  32.27 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  31.08 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  30.62 
 
 
301 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  32.25 
 
 
305 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  31.63 
 
 
297 aa  139  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  32.03 
 
 
310 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  34.48 
 
 
308 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  30.67 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  33.44 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1325  domain of unknown function DUF1731  29.45 
 
 
302 aa  136  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.492061  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  30.77 
 
 
308 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01381  putative cell division inhibitor  31.09 
 
 
308 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.384424  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  33.65 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3849  hypothetical protein  35.37 
 
 
489 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  32.81 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  34.41 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  32.7 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  32.81 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  29.64 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  29.49 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  28.99 
 
 
301 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  29.64 
 
 
301 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  30.62 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  28.99 
 
 
301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  32.25 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0123  putative cell division inhibitor  30.13 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  31.94 
 
 
304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  28.99 
 
 
301 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2361  hypothetical protein  32.26 
 
 
309 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  28.66 
 
 
301 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  28.99 
 
 
301 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  28.66 
 
 
301 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  32.59 
 
 
313 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  28.99 
 
 
301 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0133  domain of unknown function DUF1731  31.86 
 
 
316 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3001  hypothetical protein  32.18 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  32.05 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  30.99 
 
 
313 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  32.04 
 
 
296 aa  125  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0156  sugar nucleotide epimerase  30 
 
 
299 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42276 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  31.07 
 
 
296 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  31.07 
 
 
296 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  31.33 
 
 
313 aa  123  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  30.82 
 
 
307 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  29.9 
 
 
300 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2912  domain of unknown function DUF1731  34.38 
 
 
313 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0344654  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  28.48 
 
 
304 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0064  hypothetical protein  30.16 
 
 
303 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  31.49 
 
 
297 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  31.07 
 
 
296 aa  122  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  30.25 
 
 
302 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  30.25 
 
 
302 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.25 
 
 
302 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  32.9 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2666  hypothetical protein  32.47 
 
 
316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73046  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  29.41 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  32.29 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0794  hypothetical protein  29.11 
 
 
300 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0810  hypothetical protein  29.11 
 
 
300 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  31.33 
 
 
313 aa  119  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 
301 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  31.61 
 
 
298 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  31.83 
 
 
492 aa  119  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  30 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  30.84 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  31.29 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  30.52 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  32.92 
 
 
312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>