136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6794 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  100 
 
 		 331 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.27 
 
 		 337 aa  431  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.85 
 
 		 341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  46.5 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 		 352 aa  255  8e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.37 
 
 		 330 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.6 
 
 		 346 aa  243  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.87 
 
 		 335 aa  242  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.78 
 
 		 330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.83 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.99 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  42.11 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  36.68 
 
 		 345 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  37.57 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  36.71 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  37.28 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  37.28 
 
 		 341 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  37.28 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  37.04 
 
 		 340 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  37.1 
 
 		 345 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.44 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  37.01 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.21 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.5 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  37.46 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 		 338 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 		 328 aa  92.4  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  27.56 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  28.81 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  33 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  28.81 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  28.81 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  28.25 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.75 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.6 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  25.48 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.8 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.8 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  27.12 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  26.17 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  29.61 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  26.55 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  26.12 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  29.9 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.72 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  24.59 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  22.92 
 
 		 306 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  25.58 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  26.02 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  25.99 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  21.05 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  22.18 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  30.97 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.11 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  25.51 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.79 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 		 310 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0754  hypothetical protein  30.91 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.34 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  37.5 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  40.48 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4261  hypothetical protein  49.32 
 
 		 202 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.09 
 
 		 329 aa  46.6  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  35.44 
 
 		 346 aa  46.2  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  25.64 
 
 		 327 aa  45.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>