214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4756 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
320 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.19 
 
 
316 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  33.33 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  33.92 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  33.63 
 
 
340 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 
345 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  33.33 
 
 
340 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  33.33 
 
 
340 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  33.82 
 
 
345 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
346 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  34.51 
 
 
345 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  32.84 
 
 
341 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  42.19 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  37.26 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.36 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.04 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  36.56 
 
 
331 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.04 
 
 
352 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 
342 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.93 
 
 
333 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.81 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  35.46 
 
 
334 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.17 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 
330 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.62 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 
330 aa  135  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  35.03 
 
 
330 aa  126  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 
338 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 
344 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.92 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.27 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 
330 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 
328 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.72 
 
 
329 aa  96.7  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
327 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
353 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  25.48 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  25.48 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  25.1 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  24.23 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  28.99 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.56 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  37.62 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  22.96 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  36.63 
 
 
293 aa  63.2  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  35.64 
 
 
292 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  24.89 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  31.68 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  23.88 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  35.64 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.42 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  35.64 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  35.64 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  36.63 
 
 
293 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.5 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  26.98 
 
 
313 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.87 
 
 
346 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  36.63 
 
 
295 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
331 aa  59.3  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  30.69 
 
 
323 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  31.09 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.9 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.57 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  28.23 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  35.64 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.79 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
336 aa  57.4  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 
315 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.79 
 
 
309 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  28.79 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
317 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
350 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3686  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.95 
 
 
307 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.38956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.82 
 
 
311 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  29 
 
 
304 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  29.18 
 
 
694 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
327 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
329 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
312 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 
337 aa  52.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>