More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_07841 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  80.72 
 
 		 306 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  81.37 
 
 		 306 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  80.72 
 
 		 306 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  50.66 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  51.57 
 
 		 306 aa  348  8e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  49.17 
 
 		 301 aa  339  4e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  53.95 
 
 		 307 aa  329  4e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  53.29 
 
 		 307 aa  325  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  50.33 
 
 		 323 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  44.25 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.1 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.4 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.06 
 
 		 309 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  43.79 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.37 
 
 		 310 aa  265  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.49 
 
 		 310 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  33.87 
 
 		 361 aa  195  9e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43341  predicted protein  28.24 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269246 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43121  predicted protein  28.24 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154535 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43169  predicted protein  26.02 
 
 		 404 aa  106  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0856686  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.24 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 		 352 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.71 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  24.46 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.36 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.18 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  25 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  24.82 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  25.72 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  24.1 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  24.37 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  36.75 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  24.47 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  24.47 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.05 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  28.45 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  22.02 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.44 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.04 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.68 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.59 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.78 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0323  UDP-glucose 4-epimerase  25.89 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.428855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.32 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.06 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.76 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.85 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.94 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  22.54 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  25.45 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.07 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  25.19 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.69 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  23.03 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  26.67 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  27.2 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  22.09 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.21 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.03 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.17 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.32 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0308  UDP-glucose 4-epimerase  24.92 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.74 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  24.33 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.61 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  25.52 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.12 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.78 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.19 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  19.76 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.61 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.36 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  28.19 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.08 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0257  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.73 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.13 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  28.19 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  28.19 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  19.91 
 
 		 619 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>