99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1329 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  56.48 
 
 
304 aa  305  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  33.89 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  34.04 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  33.68 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  33.68 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  33.68 
 
 
293 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  33.68 
 
 
290 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  32.98 
 
 
293 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  31.63 
 
 
295 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  31.29 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
346 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
353 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.12 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  31.48 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  24.9 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  31.12 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  41.58 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  24.9 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  24.9 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  31.96 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  25 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  25.2 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
333 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
330 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  24.12 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  24.12 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  25.49 
 
 
345 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  33.04 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  28.44 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
328 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
330 aa  62.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.96 
 
 
338 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  26.34 
 
 
306 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.03 
 
 
339 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
336 aa  60.1  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  27.57 
 
 
331 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
342 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  26.55 
 
 
307 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
350 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.98 
 
 
329 aa  56.6  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 
321 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 
326 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 
330 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  25.58 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  26.32 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  25.73 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  23.39 
 
 
306 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  24.41 
 
 
341 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
338 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 
318 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  25.71 
 
 
323 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
316 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 
342 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
317 aa  46.2  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
344 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120111  normal  0.224068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  24.15 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  26.79 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.13 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.1 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  23.05 
 
 
316 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
337 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
317 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 
318 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>