92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6286 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  100 
 
 
304 aa  607  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.48 
 
 
300 aa  305  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  35.05 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  35.05 
 
 
290 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  34.02 
 
 
292 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  35.05 
 
 
293 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  34.71 
 
 
293 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  34.02 
 
 
290 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  33.68 
 
 
292 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  32.01 
 
 
295 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  32.01 
 
 
295 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
346 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.58 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.5 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.9 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.82 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  28.87 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  27.13 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  30.81 
 
 
313 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  26.46 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  27.64 
 
 
345 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  30.1 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  27.24 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
344 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
320 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  26.01 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  29.27 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  26.24 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  25.23 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.33 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  25.23 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  26.01 
 
 
341 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.26 
 
 
313 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 
335 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
338 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  22.61 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  23.16 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  25.87 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  25.13 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
342 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
331 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.97 
 
 
331 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
329 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
316 aa  52.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
326 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  21.11 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
330 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  21.11 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.72 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.12 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
342 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  28.57 
 
 
330 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  26.32 
 
 
340 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  26.32 
 
 
340 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
339 aa  45.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.47 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  26.61 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.55 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.66 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
368 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
342 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.05 
 
 
313 aa  42.7  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 
330 aa  42.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>