More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0673 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
335 aa  694    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.4 
 
 
339 aa  477  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.03 
 
 
339 aa  340  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.88 
 
 
327 aa  332  5e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.31 
 
 
338 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.23 
 
 
350 aa  318  6e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  45.57 
 
 
329 aa  316  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  47.38 
 
 
327 aa  298  8e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.24 
 
 
333 aa  294  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.74 
 
 
342 aa  285  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.43 
 
 
326 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.42 
 
 
326 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.982727  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
336 aa  183  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
331 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.11 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  28.06 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.79 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  24.7 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  24.21 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.67 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  23.32 
 
 
746 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.23 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  28.5 
 
 
324 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  28.82 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  28.82 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.8 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000493434  normal  0.801041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  24.29 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.43 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.59 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.59 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  23.51 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.71 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  24.9 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  25.31 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.29 
 
 
330 aa  63.5  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
341 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.06 
 
 
342 aa  62.8  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 
292 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.78 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  25.51 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  29.03 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  30.13 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.13 
 
 
314 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.46 
 
 
292 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  24.24 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  23.92 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.85 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 
322 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0618  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.15 
 
 
328 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
314 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 
321 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.81 
 
 
336 aa  59.7  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.01 
 
 
342 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.948095  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  27.84 
 
 
331 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  29.03 
 
 
334 aa  59.7  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  23.68 
 
 
345 aa  59.3  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.32 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.97 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  27.22 
 
 
336 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.64 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.24 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.9 
 
 
294 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.4 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.31 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
329 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.85 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>